1.成本更高
跨境電商物流的運營除了搭建跨境物流網絡，還需要考慮跨境商品關稅、商檢、跨境快遞等壹系列費用。
2.運輸周期長
跨境物流的產業鏈和環節都比較長，主要包括國內物流、國內海關、國際運輸、國外物流、國外海關。
3.物流信息化問題
目前跨境物流采用很多郵政包裹模式，物流信息無法及時跟蹤。在包裹運輸過程中，客戶無法及時了解環節、位置以及貨物是否在艙。