(1)X線片不能準確反映根尖骨質破壞量。在根尖周病變的早期，即松質骨輕微受損時，X線片上可能顯示不出來，只有密質骨受損時才顯示透射像。因此，臨床病變的實際程度比x光片上顯示的更嚴重。
(2)骨板完整與否對診斷有重要意義，但其影像在很大程度上取決於牙根的形態和位置、X線投照方向和照片質量。所以正常牙齒在x光片上可能沒有明顯的骨板。
(3)X光顯示的是三維物體的二維(平面)圖像，圖像重疊往往導致誤診。比如把多個詞根錯當成單個詞根；將下頜頦孔誤診為下頜前磨牙根尖周病變；上頜切牙孔和鼻腭管被誤認為是上頜中切牙的根尖周病變。
(4)由於投影技術或膠片處理不當，X線圖像可能失真，從而削弱X線檢查在診斷和治療中的價值。因此，提高x光片的質量和醫生在x光檢查中的閱讀能力也具有重要意義。