1，口感差異:千年果皮更薄，果肉更軟，很甜，水分更足，更像水果。
2、外觀差異:千禧果是圓臉，比櫻桃番茄小壹號，顏色鮮艷，深紅色。櫻桃番茄壹般又長又窄，尾巴尖，顏色黃。
3.產地不同:千年果產於海南和兩廣。由於海南島陽光充足，雨量充沛，這裏自然生長成熟的千年果，味道特別純正。聖女果對生長環境要求不高，我國大部分地區都可以種植，產量也比較高。壹般當年7-8月壹直到次年2月都有聖人，收益率也高。
4.產地差異:千年果是由聖女果首選品種培育而成的新品種。櫻桃番茄是從中國臺灣省引入中國大陸的。