(1)藥物可以到達較難到達的深牙周袋底部和根分叉處，在此處有助於除菌。
(2)能殺死侵入牙周袋壁的微生物。
(3)可以清除口腔非牙周袋區域的致病微生物。
全身用藥的缺點:
(1)全身給藥後，牙周袋內藥物濃度相對較低。
(2)容易誘發耐藥菌株。
(3)大劑量、長期使用抗菌藥物容易導致菌群失調。
(4)容易產生不良反應，如胃腸道反應。
(5)部分患者不易堅持遵醫囑服藥，影響療效。