如果北京酸奶是瓷瓶，制作過程是將牛奶和活性發酵菌直接放入瓶中，在瓶中完成發酵，發酵需要壹個恒溫期。這種酸奶保質期短，對儲存溫度比較敏感。如果長時間暴曬會造成二次發酵，嚴重影響口感和味道，不建議再喝。
如果北京酸奶放在塑料瓶裏，發酵好的酸奶直接用殺菌設備罐裝，密封消毒壹次再出廠。保質期相對較長，對儲存溫度的敏感性低於瓷酸奶。而且酸奶經過高溫殺菌後，活性菌存活率低，不太可能再次發酵，或者口感和味道沒有變化，可以飲用。