傳統的基因分析叫遺傳分析，基因組測序能找到遺傳分析所不能發現的基因組。還能發現與染色體高級結構和行為（重組、轉座、復制和表達調控等）有關的信息
利用基因，人們可以改良果蔬品種，提高農作物的品質，更多的轉基因植物和動物、食品將問世，人類可能在新世紀裏培育出超級物作。通過控制人體的生化特性，人類將能夠恢復或修復人體細胞和器官的功能，甚至改變人類的進化過程。