熱力滅菌有多種方式，包括濕熱滅菌和幹熱滅菌。
濕熱滅菌主要包括高壓蒸汽滅菌、常壓蒸汽滅菌、沸水滅菌、間歇滅菌等方法。幹熱滅菌主要包括火焰滅菌和幹熱高溫滅菌。滅菌時應根據被滅菌物料的無菌程度、物料的理化性質和生產中的設備狀況選擇相應的滅菌方法。壹般在相同溫度下，濕熱滅菌優於幹熱滅菌，因為蒸汽穿透力強，在含水量高的情況下原生質更容易變性凝固。如果蛋白質的含水量為0，則需要160分鐘到170分鐘才能凝固；當含水量為18%時，80 ~ 90分鐘即可固化；當含水量為50%時，56分鐘即可固化。可以看出，濕熱處理下殺滅微生物的時間比幹熱滅菌下短得多。