吳三桂想支援首都，還沒來得及，首都就淪陷了。他命令他的副將向清朝借兵。清朝順治皇帝命瑞親王多爾袞率軍星夜出發。在壹片石林中間，遇到了敵軍大將唐統，兩軍相遇，唐統敗退。
清軍進入離山海關城只有兩裏的地方。眼見形勢危急，吳三桂帶領幾名清軍軍官沖出重圍，飛臨關城東二裏的魏元寶清軍大營，跪伏在多爾袞面前。多爾袞直奔燕京，所到之處，官民無不開城迎接。當他們到達北京時，侵略軍已經燒毀了故宮，並向西撤退。吳三桂投降清朝，派清兵入關，在李自成打敗農民軍。之後清軍南下攻打南明。
順治二年(元年，1645)五月，豫親王多多等兵南下，連揚州等重鎮都到了南京。洪光皇帝被俘，200多名朝臣和公務員，以及238，000多名騎兵投降。同年夏，江陰被清。
占領南京後，多爾袞頒布剃發更衣令，強迫清朝漢人將頭發、衣服改為全服、全飾。為了捍衛民族的尊嚴和信仰，炎黃子孫發起了可歌可泣的反侵略起義。江陰八十壹日是江南人民英勇抵抗外敵入侵的代表性場景。