中醫是在中國傳統文化的基礎上誕生和發展的。
中醫學直接脫胎於中國傳統文化，與傳統文化思想的關系尤為密切，二者唇齒相依，這是中醫的壹大特色，在世界文化史上獨樹壹幟。
中國傳統文化是指在遠古或較久以前在中國區域內產生和發展的，世代流傳至今的具有自身特點的精神文化。中國傳統文化是儒、道、釋三種流派思想長期融合而來的，三位壹體，不可分割，其中以儒家思想為主體。
儒學中的天人合壹，以人為本，以和為貴，中庸等思想；道家的禍福相倚，對立統壹，沈靜無為等思想；佛教中的眾生平等，慈悲為懷等思想，均對中醫學的形成與發展影響深遠。尤其是強調人與自然界協調統壹的“天人合壹”觀，不僅是中國傳統文化的精髓之壹，也直接締造了中醫學的基本框架，為中醫學的起步與發展找到了出發點與歸宿。
中醫天人相應的整體觀念，五行相貫的藏象學說，陰陽互根的治療原則無不打上了中國古代哲學的烙印。
人的認知能力在壹定時期壹定程度上總是有限的，由於認知手段的局限，當時人們對自然界的認知是很局限的，充滿懷疑、矛盾和力不從心的感覺，既無法用精確的語言準確地描述客觀世界，更無法驗證理論的正確與否，只能從理論到理論，壹路窮推。
表現在中醫學上，就是理論內涵的不確定和外延的無限擴大。理論上的自圓其說，無可證偽和解釋的模棱兩可、歧路百出，這些都長期為人所之詬病，而且隨著時代的發展，中醫日益傾向於內省而外納不足，中醫的發展與科技的發展脫節，這壹切都成為後來傳統文化反思大潮中中醫頻遭非議的致命傷。