現階段我國經濟結構還存在著壹些方面的問題與不足。這主要體現在以下幾個方面。
產業結構缺陷：第三產業所占GDP中比重偏低
在就業結構的國際比較，同樣表明我國第壹、二產業比重偏大，而第三產業比重偏小。改革開放以來，三大產業就業人員的比例由1978年的70.5：17.3：12.2調整為2005年的44.7：23.9：31.4，但仍遠未達到基本完成工業化時第壹產業就業人數占總就業人數的比重降至20%以下的就業結構要求。
分產業看，三次產業內部結構也存在壹些不容忽視的問題：在農業方面。壹是農業基礎設施仍比較落後，二是我國農業產業化和規模化經營還處於起步階段，三是產業選擇上趨同，大宗農產品區域布局不合理，四是農業社會化服務體系不健全，農業投入的風險較大。
工業方面壹是生產結構不夠合理，表現為低水平下的結構性、地區性生產過剩，又表現為企業生產的高消耗、高成本。二是產業組織結構不夠合理。目前我國各類產業的壹個普遍現象是分散程度較高，集中度較低。三是產業技術結構不夠合理。技術和質量的提高過分依賴引進，自主開發能力弱，在激烈的國際競爭中顯得不太適應。四是高技術產業、環保產業等新興產業相對落後。
在服務業方面壹是從第三產業內部結構看，我國仍以傳統的商業、服務業為主，壹些基礎性第三產業(如郵電、通訊)和新興第三產業(如金融保險、信息、咨詢、科技等)仍然發育不足。二是第三產業增長方式粗放，效益偏低。三是市場化程度低，技術創新能力不夠GDP使用結構：投資與消費比例失衡