這些用途不同的顯微鏡可以有針對性的放大，所以對更多領域更有幫助。顯微鏡的作用使人類能夠看到更清晰的世界，這是人類的壹大幸福。
金相顯微鏡是傳統光學顯微鏡和計算機通過光電轉換的有機結合，不僅可以在目鏡上進行顯微觀察，還可以在計算機顯示屏上觀察實時動態圖像。基於計算機的金相顯微鏡還可以編輯、保存和打印所需的圖片。
樣品由精細聚焦的電子束掃描，因此樣品必須能夠承受高真空並具有合理的電導率。(這是因為妳在樣品中堆積了電子流，必須將電流導走。)SEM樣品通常塗有非常薄的碳或金屬(如金或鉻)以使其導電。
光學顯微鏡通常使用波長較長的可見光作為光源，電子顯微鏡使用波長較短的電子束作為透射源。
兩種光源的不同決定了它們不能壹起使用。
此外，光學顯微鏡是壹種非常復雜的精密儀器，需要穩定的高壓系統、真空系統、成像系統和特殊的樣品制備方法等。，遠高於普通光學顯微鏡。
那麽壹種明顯受限的樣本就是透明樣本，其中生物分子樣本是最典型的例子，因為細胞包括很多細胞器看起來是透明的，有些樣本無法染色，導致視野明亮，無法區分樣本。解決方案，光學顯微鏡，可以用暗場顯微鏡，相差顯微鏡，微分幹涉相差顯微鏡(DIC)來解決。如果需要更高的分辨率，就需要電子顯微鏡。