因為孔數比開胸少，不牽拉肋骨，所以疼痛程度會小很多，基本不會出現肋骨骨折或肋間神經嚴重損傷引起的嚴重術後疼痛。疼痛的時間可能在術後48小時內，也可以選擇術後給鎮痛泵。是麻醉科為患者準備的自控鎮痛泵，內含麻醉藥物，患者可根據自身情況添加藥物。
術後5天左右，出院後可出現面部疼痛、鈍痛、麻木、跳痛。這種疼痛可能會持續1~3個月，基本上3個月後疼痛會逐漸減輕或消失。剩下的只是胸部的麻木和輕微的腫脹感，這種感覺可能會持續更長時間，有的人可以從半年到1年不等。
肺結節的微創手術有兩種，壹種是胸腔鏡下肺葉或肺段切除，另壹種是影像CT引導下經皮消融治療肺結節。不同手術的創傷和疼痛程度有差異，具體類型如下:
1.外科胸腔鏡肺葉切除術:胸壁會留下8-10cm長的疤痕，會出現局部胸痛的癥狀；
2.CT引導下肺結節穿刺消融手術:短時間內在皮膚上留下針孔，愈合後皮膚上不留痕跡。
相對而言，CT引導下經皮消融術痛苦較小，但肺結節是采用胸外科手術切除還是CT引導下穿刺消融術治療，需要根據具體的肺結節來決定。因此，在選擇微創手術時，建議患者到專業的胸外科和腫瘤科就診，根據病竈的大小、形態和風險決定采取手術肺葉切除還是影像引導穿刺消融。