1，軟件操作方式:AE基於“層”操作，像PS；Nuke是基於節點的操作模式，不同於傳統軟件。它通過各種節點傳輸功能屬性。
2.軟件的定位:Nuke本身定位於高端影視制作；AE更難定位。它可以做低、中、高端，但是遇到復雜的文件就會捉襟見肘。
3.整合素材的能力:ae對各種格式的素材都比較包容和接受；目前nuke只支持畫面序列和mov的格式，nuke基於通道的合成軟件用於單鏡頭畫面的超高級vfx特效合成，最多支持1023通道信息的合成。
各自的優勢:
1和AE的優點:素材整合能力很強，可以使用psd ai swf gif wav格式等作為素材文件，適合處理不同大小的多鏡頭整體合成。
2.nuke的優點:nuke有更好的處理3D vfx合成的能力，視頻處理最高分辨率支持4k以上。
擴展數據:
AE適合從事設計和視頻特效的機構，包括電視臺、動畫制作公司、個人後期制作工作室、多媒體工作室等。Nuke可以為藝術家提供靈活、有效、經濟和全功能的工具，用於組合和操作掃描的照片、視頻板和計算機生成的圖像。
參考資料:
百度百科-Adobe After Effects
百度百科-NUKE