良好的水質離不開過濾系統，魚塘循環水過濾系統對維持水質的重要性不言而喻。過濾系統包括沈澱倉、豎管倉、物理過濾倉、生化倉和清水倉。將過濾池分成多個平行室的設計方法，主要水循環系統設備將濾料放置在垂直管室、物理過濾室和生化室中。通過物理和生化分離分解，將水體中肉眼可見的臟東西沈澱到物理過濾倉中。
然後在水流過生化倉時，硝酸鹽、氨氮等物質被充分分解降解，實現水質的清澈。池水流經每個過濾單元中有大量孔隙的濾料，雜質被濾料的吸附和阻隔攔截，雜質的自重被利用。沈澱在每個過濾倉底部，降解生化倉中的硝酸鹽、氨氮等物質，達到凈化水質的目的，然後用水泵將清水倉中的水抽回魚塘，實現魚塘水循環凈化。
自然降水
庭院中常采用濾塘凈水系統，有壹定面積和水量(50~200噸)的景觀魚池。太小建魚塘不劃算，太大需要修剪的過濾池面積。否則會出現水處理效果不好的問題。通常過濾池和魚塘的面積是1:5。深度和魚塘壹樣，也就是說濾塘修的越大，處理效果會越好，但是面積也會越大。
壹般魚塘的水循環周期是兩個小時壹次。如果養魚密度比較高，每小時循環壹次，濾水池的水在倉內至少停留10~15分鐘。以便於微生物和硝化細菌的培養、反應和自然沈澱。修建魚塘和鋪設管道時，進出水管要設計合理，魚塘不能有死水區，要讓水在整個池塘中旋轉。