農村汙水大部分來自廚房用水、洗漱用水、沖廁用水，三者特性相差不大。除了豐富的氮磷有機質外，還含有病原菌及其生物，包括真菌和大腸桿菌。與氮和磷相比，壹氧化碳含量不足；與大腸桿菌等汙染物相比，濁度也略高；BOD和COD通常為0.4-0.6，碳氮比通常小於5，影響汙水處理中總氮的去除率。
此外，農村汙水在壹個自然日的不同時段，水質略有不同。比如白天做飯時，動植物脂肪和SS的濃度較高，氮、磷和洗滌劑的濃度也較高。另外，農村生活汙水基本不含重金屬等物質。
大多數農村地區沒有良好的排水系統。除部分經濟條件較好的村和試點村外，大部分地區仍采用組合制。由於運行維護經費的限制，村委會負責部分汙水處理設施的運行管理而非專業技術人員，導致設備出現故障時無所作為。而且村民對農村生活汙水的處理不夠重視，不能定期檢查維護，也導致汙水處理設備的使用存在隱患。