按照慣例，可汗死後，繼承人必須由庫裏臺推薦，由氏族親屬、貴族、大臣參加。可汗和他的大臣們各自宣誓後，就可以正式繼承王位，合法行使可汗的權利。然而，蒙古仍然有財產繼承制度，由小兒子看守廚房。進入中原後，出現了漢族長子繼承制。正是由於這些並存的繼承制度，蒙古汗國與元朝在皇位繼承問題上發生了壹系列沖突，導致了蒙古汗國時期汗位的轉移和元朝中後期的宮廷政變。
同時，元朝排斥漢文化，不像後來的清朝統治者吸收了相當壹部分漢文化；所以元朝的皇位繼承並沒有繼承漢族傳統的“長子”；沒有像清朝那樣明確的制度(清朝初期，繼承人由八旗會議決定；後來是皇帝臨死前的密詔決定的，為了避免諸子奪儲，後繼無人的情況。
元朝在文化、制度、經濟等方面都落後於前朝和後朝，蒙古文化也遠遠落後於漢族文化。總之，在元朝，成吉思汗家族的所有直系後裔都有資格被稱為皇帝。就這樣，到了元末，元皇族自身之間以及元皇族與四大可汗國皇族之間的大規模內戰從未停止，出現了長達20多年的換八帝時期。內訌嚴重削弱了元朝的力量。