目前我國幽門螺桿菌對阿莫西林、四環素、呋喃唑酮的耐藥率很低或幾乎不耐藥，而對克拉黴素、甲硝唑、左氧氟沙星的耐藥率較高或偏高。推薦方案中有兩種低耐藥的抗生素組合，低耐藥的1組合和高耐藥的1組合(鉍能在壹定程度上克服耐藥性)。治療2周後，經ITT分析，根除率為80%~95%。除了抗生素的聯合應用，PPI和鉍的種類和劑量以及療程也會影響療效。
通過經驗選擇這些方案可遵循以下原則:(1)方案選擇應基於療效、費用、不良反應和藥物可得性的平衡。(2)常規詢問既往抗生素使用和不良反應史。應盡可能避免使用克拉黴素、甲硝唑和/或左氧氟沙星。(3)含左氧氟沙星的方案(根據國際慣例)不作為壹線治療；含呋喃唑酮的方案因國家醫藥產品管理新規存在申請困難(詳見第五部分“問題17”)，其他方案不分壹線二線。(4)對青黴素不過敏者，應盡量選擇含阿莫西林的方案。青黴素皮試陽性不代表對青黴素過敏，皮試陽性者可酌情再做壹次皮試。(5)耐藥率低的兩種抗生素聯合用藥容易獲得較高的根除率；而耐藥率低和耐藥率高的聯合用藥療效不如耐藥率低的聯合用藥穩定。(6)含克拉黴素和/或左氧氟沙星的方案不能重復使用，重復使用甲硝唑時應優化劑量(增加劑量至1.6 g/d)。(7)療程應盡量為14 d，除非相關研究證實10 d療程根除率≥90%，尤其是初始治療失敗後。