在定額計價模式下，政府是制定工程造價的主體。它限制了不同級別的施工企業在記錄成本時必須執行“定額直接費”或“定額人工費”的同壹標準，業主只能處於從屬地位，只能按照政府的“收費標準”計算。
(1)沒有體現資金使用中的施工順序、主從關系和時空順序。僅從會計角度規定了我國工程造價的構成，沒有體現工程造價管理的清晰思路，執行中容易混淆。
(2)不能體現建築產品的優質優價原則。業主總是希望工程質量好，價格低。但是建設優質項目的投入要大於建設普通合理項目的投入。雖然最近政府做了調整，允許雙方在自願的基礎上收取優秀項目的補償費，但如果壹方不同意，投入的費用就無法收回。所以這種方法不好掌握，容易引起工程質量差的業主不滿，必須加大施工企業的投入，打造優質工程。兩者的矛盾顯而易見。
(3)不利於招標工作。目前的工程造價計算復雜，費時費力。不僅要適用“定額直接費”，還要計算材料差價，適用定額收取管理費。同時，理論上同樣的圖紙適用同樣的定額，按照同樣的信息價格，結果應該是壹樣的。但由於操作人員的認識和水平不同，結果往往相差很大，使得招投標工作不是考察企業的綜合能力，而是考核預算預測人員的理解能力和運氣。誰讓工程預算與標底價格“撞價”，誰就有可能中標，這顯然是不公平、不合理的。
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