循證醫學不同於傳統醫學。傳統醫學以經驗醫學為基礎，即根據非實驗性的臨床經驗、臨床資料和對疾病基本知識的了解來治療病人。循證醫學並不想取代臨床技能、臨床經驗、臨床數據和醫學專業知識，只是強調任何醫療決策都要基於最佳的科研證據。循證醫學代表證據主義。壹切以證據為基礎，實踐和歷史證明對的事情才是科學。
循證醫學不同於傳統醫學。傳統醫學是以個人經驗為基礎，醫生根據自己的實踐經驗、資深醫生的指導、課本和醫學期刊上零散的研究報告來治療病人。導致壹些真正有效的療法，由於不為大眾所知，長期沒有被臨床采用。壹些實際上無效甚至有害的療法，因為理論上可能有效而被廣泛使用了很長時間。