“微”是微小的意思。微生物是太小而無法用肉眼看到的生物，必須借助顯微鏡才能看到。微生物分布在空氣、土地、河流和海洋中，在人、牲畜和植物中也有很多種微生物，其中壹些對人類有致病性和危害性，但也有很多對人類有益的微生物。比如釀酒的曲是由某種微生物制成的，整個發酵行業都離不開微生物。存在於土壤中的微生物稱為土壤微生物，種類繁多，大致可分為細菌、真菌、放線菌等。有些藻類和線蟲也可以歸為土壤微生物。
微生物與土壤肥力密切相關。肥沃的土壤微生物多，貧瘠的土壤微生物少，沒有微生物的土壤就成了死土。這是因為土壤中有機質的分解和植物所需各種養分的轉化都離不開微生物的活動。土壤微生物還能分泌多種酶和生長刺激劑，促進植物根系生長。把土壤微生物比作植物的胃並不為過。土壤微生物的另壹個重要功能是通過其生命活動形成腐殖質，從而將土壤無機顆粒粘合在壹起形成團聚體，既能保肥保水，又能通氣促進根系生長，改善土壤物理性質，這是土壤改良的重要目標。
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