有機肥中的維生素、黃腐酸、黃腐酸、褐黃腐酸以及低分子量有機酸和丁酸不僅直接影響植物的營養功能，還具有生理活性和刺激作用，增強呼吸作用，促進根系生長，並直接影響土壤環境的形態。
缺點:
使用有機肥還有養分含量低，不易分解，不能及時滿足農作物高產的要求等缺點。傳統有機肥的生產和使用也很不方便。人畜糞便、垃圾等有機廢棄物是壹種骯臟、腐爛、發臭的物質，含有許多病原微生物或混有壹些毒物，是重要的汙染源。
無機肥料的優點:
無機肥料就是礦物肥料，也叫化學肥料，簡稱化肥。因其成分簡單、有效成分高、易溶於水、分解快、易被根系吸收而被稱為“速效肥”。
缺點:
無機肥是化學肥料，將高純度的無機鹽嵌入土壤中。這些鹽溶解到土壤中後被植物吸收。由於無機鹽濃度高，容易破壞土壤的酸堿平衡，危害環境。
擴展數據
無機肥料和有機肥料的區別
不同成分
含碳化合物除二氧化碳、碳酸、碳酸鹽等簡單化合物外，主要含有C、H、O、H、O，稱為有機化合物。不含碳的化合物，包括上面提到的簡單化合物，稱為無機物。有機肥是指主要含有前壹種物質的肥料。無機肥料是指含有第二類化合物的化學肥料。
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