根據版本中是否會出現新的卡牌，可以將萬智牌遊戲中所出版過的系列分成兩類：核心系列和延伸系列。所有的萬智牌延伸系列，以及所有第六版（含第六版，簡體中文則是從第五版開始）以後的核心系列，都有了壹個系列符號來說明該牌出現的版本。系列符號通常被印刷在萬智牌卡牌靠右的位置，插畫下方，文字敘述框上方。 核心系列（Core Sets）是萬智牌發行的其中壹些系列的統稱。這些系列都有壹些***同的特點：通常包含約三百多張的卡牌。該系列裏的牌都曾經在以前的出版的系列中出現過。（稱為“重印”） 這些系列的牌的邊框都是白色的。（但是萬智牌壹開始的兩個系列Alpha和Beta也被認為是“核心系列”。） 從第十版開始，核心系列不再使用白色邊框。2009年起，核心系列不再使用版次命名，而以年份命名，並開始包含全新的卡牌，而非全部重印。第壹個包含新卡牌的核心系列是核心系列2010（2009年7月發行）。從核心系列2011開始，每個核心系列還將回顧壹個之前擴展系列中的關鍵字異能或特殊機制。
另外，每壹個核心系列中包含5種基本地牌，每張基本地牌都會有4種不同的圖畫。
萬智牌的核心系列有：
Alpha（第壹版） 295張 1993年8月
Beta（第壹版增刷） 302張 1993年10月
Unlimited（第二版） 302張 1993年12月
Revised（第三版） 306張 1994年4月
第四版 378張 1995年4月
第五版 449張 1997年3月
第六版 350張 1999年4月
第七版 350張 2001年4月
第八版 350張 2003年7月
第九版 350張 2005年7月
第十版 383張 2007年7月（此系列為黑色邊框）
核心系列2010(M10) 249張 2009年7月
核心系列2011(M11) 249張 2010年7月 回歸機制：占蔔
核心系列2012(M12) 249張 2011年7月 回歸機制：嗜血
核心系列2013(M13) 249張 2012年7月 回歸機制：頌威
核心系列2014(M14) 249張 2013年7月 回歸機制：裂片妖
核心系列2015(M15) 249張 2014年7月 延伸系列（Expansion Sets）則與核心系列不同，在每個延伸系列中都會有新的卡牌被印刷，使得萬智牌此遊戲不斷的擴展。從Ice Age系列開始，萬智牌的延伸系列以“環境”(Block)的單位發行。在壹個環境中，通常包含3個不同的延伸系列——壹個於秋季發行的大系列（包含306張左右的卡牌），以及兩個小系列（各約有165張左右的卡牌，分別於大系列發行的次年春季、夏季發行）。處於同壹環境的三個系列都在同壹個故事背景下發生，兩個小系列則為大系列的延續。然而，洛溫環境與暗影荒原環境，卻都只有壹大系列加壹小系列為壹環境。大系列與核心系列相同，包含四款不同的圖畫的基本地，小系列不含。
萬智牌出版過，或即將出版的延伸系列有：
早期系列
Arabian Nights（阿拉伯之夜）
Antiquities（古文明之戰）
Legends（傳承）
The Dark（闇黑）
Fallen Empires（墮落王朝）
Homelands（家鄉）
Ice Age環境（1995-96,2006）
Ice Age（冰雪時代）
新機制：累積維持、雪境(snow)類別
Alliances（同盟）
新機制：替費咒語
Coldsnap（驟霜）（2006年7月上市）
Mirage環境（1996-97）
Mirage（海市蜃樓）
新機制：側面攻擊、時間跳躍
Vision（憧憬）
Weatherlight（晴空號傳說）
特有機制：墳墓場順序
瑞斯環境（又名暴風雨環境）(1997-98) 與克薩環境並列最多禁限牌的環境
Tempest（暴風雨）
新機制：購回、次元幽影、裂片妖
Stronghold（天羅城塞）
Exodus（出瑞斯記）
克撒傳環境（又名神器環境）(1998-99) 與瑞斯環境並列最多禁限牌的環境，多數牌壹路從當時的標準禁到傳承，並且在古典被制限
克撒傳
新機制：返響、循環
遠古遺產
新機制：可以變成生物的地（俗稱變人地）
天命之戰
瑪凱環境（1999-2000）
瑪凱迪亞
新機制：反抗軍
宿敵
新機制：消退
預言
大戰役環境（2000-01） 主題是“多色”，多色牌自天羅城塞後兩年多未再出現，在此環境大舉復出。大戰役與其子系列時空轉移著重鄰色多色牌，啟示錄則是著重對色多色牌。
大戰役
新機制：增幅、多色優勢、雙色連體咒語卡。
時空轉移 143張
新機制：傳送，戰巫師，雙增幅咒語。
啟示錄 148張
新機制：進化體
奧德賽環境（2001-02） 主題是“墳場”，相當多牌張與墳場相關，讓墳場成了不容忽視的資源。本環境亦打破了系列五色牌張的平衡，絕境的黑色牌最多，而白綠牌減少，到了神譴則反過來，白綠的牌較多，黑色的牌變少。此外神譴所出的五張祈願牌讓移出遊戲區的牌（備牌）也可以成為資源使用。
奧德賽 335張
新機制：返照，門檻。
絕境 143張
新機制：瘋魔。
神譴 143張
新機制：化身。
石破天驚環境（2002-03） 主題為“部族”，環境裏充滿著針對特定種族設計的牌。白色有士兵、藍色有魔法師、黑色是僵屍、紅色是鬼怪、綠色是妖精。不過鬼怪跟妖精在上壹個環境（奧德賽）缺席，此次的出現被視作復出。黑色與白色有僧侶。紅色與綠色有野獸。
石破天驚 335張
新機制：變身 回歸機制：循環
萬馬千軍（本系列只有生物牌！）145張
新機制：挑撥，增強
劫運降臨 143張
新機制：地循環，風暴
秘羅地環境（2003-04）主題為“神器”，此環境為萬智牌采用新牌框後發行的第壹個黑邊（擴充環境），具有諷刺意味的是，正是由於此環境以神器為主題，才使得新牌框白色和神器的顏色相近不易區分為眾多牌手所詬病。此外，由於在設計時未能將此環境特有的神器相關的機制與擁有的大量神器牌之間互動協調好，導致此環境在標準賽制中被禁用的牌達7張之多。為後《克撒傳》環境之最。另外，此環境為萬智牌帶來的壹種新的卡牌副類別～武具。
秘羅地 291張
新機制：***鳴、壓印、打包。新牌類別：武具
玄鐵 165張
新機制：套件、“不會毀壞”。
五色曙光 165張
新機制：輝映、占蔔
神河環境（2004-05）主題為“傳奇”，故事發生在充滿日本風味的世界中，此點從該系列的英文名Kamigawa可見壹斑。從此環境開始，原本的“傳奇規則”被改動成為“同時在場的同名傳奇壹同入墳場”。
神河群英錄 301張
新機制：古咒、倒轉牌、通聯古咒、武士道
神河叛將譜 170張
新機制：忍術、獻祭、轉生
神河任俠傳 170張
新機制：魂力、掃平、歷傳
拉尼卡環境（2005-06）主題為“雙色”，大戰役環境後第壹個以多色牌為主體的環境。引入“混血牌”、“混血法術力”機制，將萬智牌五種顏色兩兩組合成十個公會，每個公會都有自己獨特的世界觀和異能。此環境產生很多分支劇情，甚至各公會都有獨特圖騰印在卡上，可惜沒有繼續延伸下去，讓不同公會圖騰產生對戰上的功用或相克。
拉尼卡公會城 291張
登場公會：葛加理（黑綠）、底密爾（藍黑）、波洛斯（紅白）、瑟雷尼亞（綠白） 新機制：發掘、易質、輝耀、召集
十會盟 165張
登場公會：古魯（紅綠）、伊捷（紅藍）、歐佐夫（黑白） 新機制：嗜血、覆誦、纏身
紛爭 190張
登場公會：拉鐸司（紅黑）、析米克（藍綠）、俄佐立（白藍） 新機制：背水戰、接殖、預報
時間漩渦環境（2006-07）主題是“時間”，時間漩渦代表“過去”，比其它大系列多了121張懷舊牌稱之為時間轉移牌。許多過去的經典異能均在此環境中重現。而時空混沌代表“現在”，以弄亂五色定義的牌（以往出現在白色的牌出成黑色，出現在紅色的牌出成綠色）作為時間轉移牌。預知將來則是代表“未來”，其時間轉移牌使用了將來才要使用的機制與異能，帶有預告萬智牌未來走向的意思。
時間漩渦 286+122張
新機制：閃現、轉瞬、延緩
時空混沌 168張
新機制：消逝
預知將來 180張
新機制：聲威、系命、延勢、帷幕、死觸、劇毒、構工、抵受、掘穴、墳場風暴、論命、狂熱、易形、類別循環 新牌類別：部族、工事、裝置（至今仍未實現）
洛溫環境(2007-08)
洛溫 286張
新機制：化形、奪冠、呼魂、掩蔽 新牌類別：旅法師
晨光 150張
新機制：血族、補強、伺機
暗影荒原環境(2008)
暗影荒原 286張
新機制：協力、留存、幹枯
暮光 180張
新機制：追溯、渲色
阿拉若斷片環境(2008-09)主題為“斷片”，原本5色法術力俱全的阿拉若世界在數千年前被分為了5個斷片，每個斷片以壹個法術力為主，2個相鄰法術力為輔，缺失另外兩種法術力，使得5個斷片經過數千年的演變後成了完全不同的5個世界，每個世界都有自己特有的機制。白色的班特為頌威，藍色的艾斯波為神器生物，黑色的格利極為破墳，紅色的勇德為吞噬，綠色的納雅則是力量大於等於5的生物作門檻。“阿拉若斷片”中每個顏色擁有壹個傳令，分別對應每個世界壹個秘稀生物，並出現3位鵬洛客：艾紫培，泰茲瑞和薩坎沃。“聚流”中各種機制開始跨色擁有，並出現鵬洛客尼可波拉斯。“阿拉若新生”則是萬智牌歷史上第壹個全混色系列，所有牌的背景全是金色，所有牌都是混色，也代表著新生後的阿拉若重新擁有了所有5種魔法力。
阿拉若斷片 234張
新機制：頌威、破墳、吞噬
聚流 145張
回歸機制：領土
阿拉若重生 145張
新機制：傾曳
贊迪卡環境(2009-10)主題為地和探險。
贊迪卡 234張
新機制：地落、夥伴(ally) 回歸機制：增幅
天地醒轉 145張
新機制：多重增幅
奧劄奇再起 233張
新機制：殲滅、升級、彈回、替身甲、奧劄奇
秘羅地創痕環境(2010-11)
秘羅地創痕 234張
新機制：增殖、侵染、金技。
圍攻秘羅地 155張
新機制：戰嚎、活化武器。
新非瑞克西亞 175張
新機制：非瑞克西亞法術力。
依尼翠環境(2011-12)
以歌德式故事為主題的環境，壹個人類和各種歌德式怪物***同存在的世界，有大量和墓地互動的魔法，主要的種族有人類(綠白)、狼人(紅綠，所有的狼人都是雙面牌，會隨該回合施放的法術數量來決定會否翻面)、精怪(藍白)、吸血鬼(紅黑)和靈俑(藍黑，黑色的是傳統的靈俑，藍色的則是科學怪人式的怪物)。 依尼翠 264張 特有機制：雙面牌(滿足特定條件就會轉化，翻到牌的另壹面)、喪心(本回合有生物死亡的話，卡牌會有替代或額外的效果)、詛咒(結附於牌手並產生負面效果的結界)、返照(復出異能) 黑影籠罩 171張 特有機制：命懸壹刻(生命值5或以下，卡牌會有替代或額外的效果)、不息(當具不息異能的生物死去時，若其上沒有+1/+1指示物，則將它在其擁有者的操控下返回戰場，且其上有壹個+1/+1指示物。) 艾維欣重臨 244張 沒有雙面牌，所以沒有狼人，以種族為狼的衛狼替代，可獨立進行限制賽的系列 特有機制：魂系(具魂系異能的生物可和其他生物組成搭擋，組成搭擋的雙方都會得到特殊能力)、奇跡(若該回合抓到的第壹張牌是具奇跡異能的牌的話，可以奇跡費用施放該魔法)，另外還有非關鍵字機制：雲移(把生物移出對戰後馬上重新放進戰場中)，獨行俠(指那些只有自己單獨在場時會比較強的生物) 再訪拉尼卡環境(2012-13) 這是2005年出的“拉尼卡環境”的續篇，故事接續在十會盟失效後，十個公會所發生的事情。 再訪拉尼卡 274張 登場公會：俄佐立（白藍）、伊捷（紅藍）、拉鐸司（紅黑）、葛加理（黑綠）、瑟雷尼亞（綠白） 特有機制：拘留、超載、脫韁、食腐、殖民 兵臨古城 249張 登場公會：歐佐夫（黑白）、底密爾（黑藍）、古魯（綠紅）、波洛斯（紅白）、析米克（藍綠） 特有機制：敲詐、暗碼、血激、協戰、進化 巨龍迷城 156張 十個公會全部登場。10張公會門牌為再訪拉尼卡與兵臨古城各五張公會門牌的重印版。每個補充包中固定壹張的基本地牌除了全部用公會門取代外，還擁有獨立的稀有度規則，有機會在地牌的位子抓到再訪拉尼卡與兵臨古城的稀有雙色地牌或巨龍迷城的秘稀地牌。 特有機制：連體牌（復出異能）、融咒(有此異能的連體牌能同時該牌二邊的效果) 塞洛斯環境(2013-14) 以希臘神話為主題的環境，壹個英雄，怪獸和眾神***同存在的環境。 有大量的結界存在的環境，結界代表神界，神界的領?和在其中生活的子民都是結界生物，而神所使用的兵器則是結界神器。 塞洛斯 Theros (THS)249張 有5位純色神登場 特有機制：神授、獻力、占蔔（復出異能）、勇行、蠻化 天神創生 Born of the Gods (BNG)165張 有5位鄰色神登場 特有機制：啟悟、致敬 尼茲之旅 Journey into Nyx (JOU)165張 有5位對色神登場 人類對眾神的信仰有所減弱，所以只剩下神還有獻力異能 特有機制：星彩、積力
韃契可汗環境(2014-15) 韃契可汗 Khans of Tarkir (KTK)269張 五個部落在合力消滅龍族後，就開始互相爭戰的世界 以三色(褉形色)為主題的環境 登場部落：阿布贊（白黑綠）、潔斯凱（藍紅白）、蘇勒臺（黑綠藍）、瑪爾都（紅白黑）、鐵木爾（綠藍紅） 特有機制：延生、靈技、掘穴（復出異能）、突擊、威猛、變身（復出異能） 龍命殊途 Fate Reforged (FRF)185張 韃契可汗壹千年前的世界，壹個龍族依然存在的過去世界，五個部落必須***同合作才能對抗龍族 沒有三色卡 有部分韃契可汗系列的牌重印，並配合為了配合這個有龍存在的世界而有新的插畫和敘述文字 巨龍族群的卡牌上有對應的標記，和部落的標記有些差異 特有機制：振勵、靈技、掘穴（復出異能）、掩襲、威猛、變身（復出異能）、顯化(變身異能的前身) 韃契龍王 Dragons of Tarkir (DTK)264張 韃契環境的另壹條世界線，龍族依然存在的世界，可汗成了歷史，人類的統治者成了龍王 五大部落變成了巨龍族群，部落的標記和名稱都改變了 韃契可汗中的可汗依然以傳奇生物的形式存在，但都有了不同的經歷 登場部落：卓茉卡(白綠)、歐祝泰(藍白)、席穆嘉(藍黑)、寇安甘(紅黑)、安塔卡(紅綠) 特有機制：振勵、彈回（復出異能）、榨取、掩襲、強橫、威力變身
萬智牌：起源 Magic Origins 272張
萬智牌：起源著眼於五位標誌性鵬洛客最初的故事： 分別是基定、傑斯、莉蓮娜、茜卓和妮莎。 妳會了解到他們來自何處，如何點燃火花，以及之後發生的故事 。
特有機制：雙面鵬洛客、銘勇、精熟咒語、威懾（復出異能）、靈技、占蔔（復出異能）
再戰贊迪卡環境（2015-16）
再戰贊迪卡 Battle For Zendikar (BFZ)274張
基定帶著傑斯來到贊迪卡，試圖解開「晶石之謎」。但當他們抵達海戶難民的避難營地時，卻發現正在上演大屠殺。 傑斯在展開研究之前，他必須和基定從成群結隊的奧劄奇中殺出壹條血路，找出幸存者 。
特有機制：醒轉、攝食、虛色、地落（復出異能）、夥伴（復出機制）、奧劄奇（復出機制）
守護者誓約 Oath Of the Gatewatch(OGW） 184張
保衛贊迪卡時空的戰鬥越趨激烈。 強大的鵬洛客與贊迪卡人並肩作戰，對抗吞噬萬物的異界來客奧劄奇。 鵬洛客會冒著生命危險為贊迪卡而戰嗎？ 還是回選擇拋棄世界撤往安全地帶？
特有機制：無色法術力符號、齊力、支援、潮湧
依尼翠暗影環境（2016）
依尼翠暗影Shadows over Innistrad 297張
在此大陸上，人性被吸血鬼、狼人、靈俑和惡鬼所威脅，他們的守護天使最終還是回歸了，但是隨她而來的又是什麽新的邪惡呢？
特有機制：雙面牌（復出異能）、列表牌（復出異能）、躁狂、探查和線索、瘋魔、潛匿 盒裝系列
'盒裝系列'是威世智為配合歐美國家贈送聖誕禮物的習俗，在歲末推出的特殊禮盒系列，以供饋贈親友或自用。其中的牌來自各個不同系列，並且附上精美的解說手冊，讓讀者能對此遊戲的歷史有更多認識。
萬智牌已出版的盒裝系列有：
Multiverse Gift Box (1996) Anthologies（最精選）(1998) Battle Royale（勝者為王）(1999) Beatdown（強襲猛攻）(2000) Deckmasters (2001)
雞飛蛋打系列
'雞飛版'(Un-)系列是針對休閑玩家所設計，提供許多嚴肅競賽中無法享受的樂趣。這些牌之牌框均為銀色，除了基本地之外，均不可在比賽中使用。
而雞飛版本身異常精致的雞飛基本地則也是雞飛版的特色...版本內唯壹兼具雞飛、收藏、實用的牌
萬智牌已出版的雞飛版系列有：
Unglued（雞飛版）(1998) 主題是雞，標誌：混沌碎紙（惡搞正規賽的永禁牌：混沌衛星） Unhinged（雞飛版第二代）(2004) **這個系列起。WOTC在提升夏季銷售上做了壹定的努力 主題是驢子(ass，隱喻屁股)，標誌：驢蹄
而雞飛系列主要針對幾個點進行惡搞：
牌的長相：版本內標準就是突出圖片框格，不用說畫歪或者側放
使用牌的方式：用撕的、丟的、貼額頭...
牌的效力範圍：可以請飲料、打到隔壁桌、用手碰到就觸發、...
牌的超強異能：很多人夢寐以求、希望大會在正規版本出來的牌，有時也會在這邊出現
牌的好用度：絕大多數是“雞肋”不能形容的（只是很好笑），另外的則是妳會想在正規戰放4張正邊
牌上面的類型：魔法力標誌、畫家...
在沒有主系列的單數年夏天
繼04年後，2006年補出版了 驟霜（十年前冰雪系列的第三系列，在此確定家鄉屬於獨立環境，不屬於冰雪環境）
08年則是重新調整張數後，將出現特殊的兩個短環境。 '編年史'（Chronicles)僅包含125張牌，是為滿足玩家對絕版牌之需求所發行的特殊系列。此系列牌之牌框均為白色，並且其上之系列符號為該牌首度印行時的系列符號；此作法為本系列的特殊處理，並且往後不再采用。
Chronicles（編年史）(1995)