壹、基礎設施落後
主要體現在兩個方面，壹是冷藏運輸。目前，我國冷鏈運輸車輛大多靠國際海運報廢或即將淘汰的海運冷藏集裝箱長途運行，現代化冷藏運輸車輛嚴重不足。冷藏技術和工藝落後，缺乏標準化的保鮮冷鏈運輸車廂和溫控設施，無法系統地為易腐食品的流通提供低溫保障。冷藏運輸率(即冷藏運輸運輸的易腐貨物比例)約為10% ~ 20%，而歐美日發達。
在所有國家都達到了80% ~ 90%。由於運輸過程中損耗較高，整個物流成本占易腐商品成本的70%，而按照國際標準，易腐商品的物流成本最高不超過其總成本的50%。我國冷藏物流損失每年超過750。
1億元。然而，國內企業也積極參與基礎設施的研發。據悉，CIDI研發了壹款智能多功能冷藏車“智能保鮮倉”。通過多功能保鮮技術(負壓控制技術、氣體調節技術、乙烯控制技術、內部流場分析技術)的應用，新鮮果蔬運輸幾乎為零，箱內貨物溫差控制在1，箱內所有數據均可被托運人監控。第二，冷庫。在冷鏈物流的冷藏設備環節，
目前，我國冷庫總容量超過700萬m？但冷庫結構不合理，重視肉類冷庫的建設，輕視果蔬冷庫的建設；重視城市經營性冷庫，輕視產地加工冷庫建設；重視大型冷庫，輕視批發零售冷庫建設。
二是完整獨立的冷鏈系統尚未形成
目前中國的冷鏈還沒有形成體系，不管從我
就中國經濟發展的消費和內需而言，仍與發達國家同步。
比，差距非常明顯。目前，我國約90%的肉類、80%的水產品、大量的奶類和豆制品仍在無冷鏈保障的情況下銷售。雖然冷凍食品產銷冷鏈略好，但當部分產品流入巴紮打散零售時，冷鏈就中斷了，不是“全程冷鏈”。
第三，第三方物流發展滯後
目前，易腐食品生產企業或經銷商的自營物流和第三方物流都存在，但兩者占總物流量的比例前者約為80%，第三方物流約為20%。比如國內知名的雙匯、三全等食品巨頭，大多依靠自己的冷鏈產品。
流來完成服務。冷鏈物流中第三方物流發展滯後，服務網絡和信息系統不夠完善，極大地影響了冷鏈物流在途的質量、準確性和及時性，造成冷鏈物流成本高、商品損耗率高。很少有冷鏈物流企業能夠保證整個供應鏈的溫度控制，這就使得大部分廠家不願意也沒有能力放心的將冷庫物流業務外包出去，只能自己運營。
即使外包，也是區域局部配送，短途冷藏運輸。
這也在壹定程度上阻礙了第三方冷藏物流的發展。
第四，冷鏈物流缺乏標準化
要建立物流行業相關的國家標準，對已經進入和即將進入物流市場的企業進行標準化和規範化管理。到目前為止，我國在冷鏈物流方面還沒有可供參考和執行的具有約束力的標準，導致冷凍食品質量參差不齊。詳細而系統的技術標準，如冷鏈能量損耗與效率標準、冷鏈最佳運行標準、冷食衛生安全標準、冷庫環境溫度和冷庫運輸溫度控制標準，
冷鏈物流行業的管理要求和規範、冷鏈運輸行業的技術標準和設備標準、冷鏈運輸行業的操作流程和功能模塊的標準化等尚未出臺，嚴重制約了我國冷鏈物流行業的發展。
五、冷庫物流技術和管理水平不高。
我國制冷保溫技術亟待發展，有效溫控設施投入有限，訓練有素的制冷物流供應鏈管理和操作人員嚴重缺乏，先進的全程制冷溫控運營管理系統亟待建立，導致各環節信息閉塞，凍結。
產品在運輸過程中不必要的延誤和增加的風險已經嚴重制約了中國物流業的發展。物流行業整體管理水平不高，不同程度地存在市場定位不準、服務產品不合格、內部結構不合理、運作不規範等問題，影響了冷鏈物流行業的健康發展。
六是信息化水平低，管理者素質有待提高。
冷鏈物流不同於普通物流，其硬件水平和貨物操作要求比普通貨物更加剛性，對操作人員的信息配置、管理水平和應急處理能力要求更高。我國整體物流信息化水平較低，冷鏈運輸行業信息化現狀不容樂觀。
操作人員大多由普通物流轉型而來，不僅不熟悉產品特性，更不熟悉冷鏈物流的運作要求，冷鏈物流的應急預案能力亟待提高。