牛欄江德澤水庫壩址以上集水區為牛欄江流域上遊保護區，牛欄江德澤水庫壩址以下集水區為牛欄江流域下遊保護區。第五條牛欄江流域上遊保護區分為水源保護核心區、重點汙染控制區和重點水源保護區。
(壹)水源保護核心區包括德澤水庫庫區和德澤水庫以上牛欄江幹流區。德澤水庫庫區為德澤水庫正常蓄水位1790米，沿岸延伸2000米。面積超過壹級山脊線的，按照壹級山脊線劃定。德澤水庫以上牛欄江幹流區域是指德澤水庫以上幹流水域(包括幹流源頭程依娜岔口至嘉裏則堆龍江河段)及其兩側1.000米延伸部分。面積超過壹級山脊線的，按照壹級山脊線劃定。
(二)重點汙染控制區是水源保護核心區以外、流域內的壩區，以及花莊河、馬國河、普沙河、米良河、堆龍河、楊林河、匡龍河、前進河、馬龍河的水域及其兩側各3000米的範圍。面積超過壹級山脊線的，按照壹級山脊線劃定。
(三)重點水源保護區是指除水源保護核心區和重點汙染控制區以外的流域內的匯水區域。第六條牛欄江流域下遊保護區分為汙染控制區和水源保護區。
(壹)汙染控制區為牛欄江幹流以外的壩區和河岸帶。
(二)水源保護區是指流域內除汙染控制區以外的集水區域。第七條牛欄江流域上遊保護區和下遊保護區的具體範圍，分別由昆明市人民政府、曲靖市人民政府和昭通市人民政府依據本條例劃定，並向社會公布。第八條牛欄江流域水質按照《地表水環境質量標準》ⅲ類水質標準保護。第九條省人民政府領導牛欄江流域保護工作，負責綜合協調、及時處理牛欄江流域保護的重大問題。
省人民政府建立了由昆明市人民政府、曲靖市人民政府、昭通市人民政府和省直有關部門參加的牛欄江流域保護協調機制。
牛欄江流域保護實行屬地管理。昆明市人民政府、曲靖市人民政府、昭通市人民政府是本行政區域內牛欄江流域保護的責任主體，全面負責本行政區域內牛欄江流域的保護工作；牛欄江流域各縣(市、區)人民政府負責具體保護工作。第十條牛欄江流域實行保護目標責任制。省人民政府應當制定保護目標，並負責對昆明市人民政府、曲靖市人民政府和昭通市人民政府進行考核。第十壹條省人民政府、昆明市人民政府、曲靖市人民政府、昭通市人民政府和牛欄江流域的縣(市、區)人民政府應當將牛欄江流域保護經費納入本級財政預算予以保護。
在牛欄江流域收取的水資源費和排汙費應當全部用於牛欄江流域水資源的節約、保護和管理以及水汙染的防治。第十二條省人民政府應當建立生態補償機制，加大財政轉移支付力度，多渠道籌集資金，支持和改善牛欄江流域居民的生產生活條件。
牛欄江流域縣級以上人民政府(以下簡稱縣級以上人民政府)應當加大產業結構調整力度，從源頭上控制和減少汙染源。第十三條在牛欄江流域內從事活動的單位和個人都有保護牛欄江的義務，並有權勸阻和舉報違反本條例規定的行為。
縣級以上人民政府和有關部門應當對保護牛欄江流域做出顯著成績的單位和個人給予表彰或者獎勵。第二章機構和職責第十四條省人民政府水行政主管部門負責牛欄江流域水資源保護的監督管理；省人民政府環境保護行政主管部門負責牛欄江流域水汙染防治的統壹監督管理。
省人民政府發展改革、工業和信息化、財政、國土資源、住房城鄉建設、交通運輸、農業、林業等行政主管部門在各自職責範圍內負責牛欄江流域保護的相關工作。第十五條昆明市人民政府、曲靖市人民政府和昭通市人民政府應當履行下列保護和管理職責:
(壹)宣傳和貫徹有關法律法規；
(二)編制本行政區域內牛欄江流域水汙染防治和水資源保護專項規劃；
(三)落實牛欄江流域保護目標責任制，確保出境斷面水質達標；
(四)制定本行政區域內牛欄江流域保護措施和規劃，並組織實施；
(五)組織制定和實施本行政區域內牛欄江流域突發水汙染事件應急預案；
(六)對本行政區域內牛欄江流域重點水汙染物排放總量控制指標進行監督檢查；
(七)督促有關縣(市、區)人民政府和本市有關部門做好牛欄江流域的保護工作；
(八)依法履行與牛欄江流域保護相關的其他職責。