645年6月，長兄中臣鐮足親王奪取舊貴族控制的政權，建立孝德天皇，模仿中國的建制，國號大華。646年頒布“由大變新”的詔書，確立了中央集權的國家制度，推動了日本社會由奴隸社會向封建社會的轉變。從此，日本設官求學，壹方面繼續向中國派遣留學生，另壹方面仿照中國唐朝的教育制度，建立了日本的貴族教育制度。668年，長兄太子正式登基，成為天之帝。在教育方面，開始建立大學，去大學讀書的貴族子弟被稱為博士生。大寶元年(701)，耐力王子和藤原布比制定了《大寶法》，從法律形式上肯定了大華革新以來所采取的各項措施。《大寶法令》的“學令”部分對大學和國學做出了各種規定，這是日本教育發展史上的壹件大事。根據《大寶法》規定的教育制度，京都設置大學(或大學堂)，地方設置國學。經過長期的戰爭和分裂，經濟實力雄厚的織田信泰、豐臣秀吉、德川家康等封建領主相繼崛起，逐漸形成統壹全國的力量。1603年，德川家康獲得“外敵入侵將軍”稱號，在江戶(東京)建立幕府，恢復中央集權制，完成了軍事上政治上統壹日本的大業。從那以後，直到明治維新的260多年，被稱為江戶或德川幕府時代。
江戶時代，幕府為了維護封建等級制度，推崇中國宋理學家朱創立的學派。日本傳統宗教的神道思想在和學(或國學)中得到了發展。為了防止歐洲殖民勢力的入侵，幕府采取了“鎖國”政策，禁止與除中國和荷蘭以外的其他國家進行貿易。日本只能通過荷蘭人了解西方的文化和科學知識。因此，西方科學文化在當時被稱為“藍雪”，並在18世紀開始傳播。儒學、和學、藍學等各種學派在不同階段、不同程度地影響了日本的學術思想、教育理論和教學內容。江戶時期，文化教育呈現復興趨勢，教育機構逐漸發展，辦學形式多樣。教育機構分為:幕府學校、藩屬學校和“人民”教育機構。著名的幕府直屬學校有長平阪本所、和夫所、開城所、醫學所等。昌平阪本院是最重要的儒學中心，有供奉孔子的神社。何雪工作坊是教授日本漢學的中心。開城學院是教授西方文化和科學知識以及西方語言的中心。醫學研究所教授荷蘭醫學。藩校壹般位於大明境內，主要是培養各種藩武士。宗學的教學內容開始同時以國學書籍和武術為主。1715以後，逐漸增加了現代科學知識的教學內容，如數學、醫學、航海和軍事技術、西文等。，其中有些還被研究學習過。“大眾”教育機構包括農村學校、私立學校、寺廟、心理學和實踐學習講習班以及其他類型的學校。農村信貸有兩種:宗族或諸侯為其子女開辦的學校和普通人在農村設立的學校。前者類似於諸侯學派，後者類似於廟堂。私塾是個別學者在各地創辦的，對江戶時代文化科學的發展起到了很大的作用。江戶時代初期的殿宇多位於殿內，之後殿外的殿宇逐漸增多。到明治維新前夕，已經有兩萬多座寺廟。寺廟房屋的組織者包括戰士、僧侶、醫生和神，以及平民。學生被稱為“寺童”，來自各行各業，多為平民。學習的主要科目是閱讀、寫作和算術。這是壹個大眾教育機構。為明治維新後普及初等教育奠定了壹定的基礎。