可見，中西醫學，壹個是以“功能人”為理念的獨特的哲學醫學理論體系，壹個是以“解剖人、物理人”為理念的現代醫學新理論體系。兩者都不是壹門以全人為研究對象的科學，兩者在理論上都不科學，必然會影響各自的發展。事實也證明，這壹切，中醫長期停滯不前，療效不壹定。西醫雖已發展到基因、分子水平，但疾病發病率居高不下，多數疾病病因不明，發病機制不明，治療受到限制。面對輕微的非典、禽流感，束手無策，而面對糖尿病、癌癥、心腦血管疾病、尿毒癥等諸多疾病，不得不求助或使用中醫進行治療。壹個是療效不確定，壹個是某些甚至相當多的疾病無法治療，這就是中西醫結合的原因。但因為是兩套理論，是兩輛跑在路上的車，所以理論上沒有結合的可能，只是壹種形式上的融合。因此，西醫對於疑難雜癥不得不向中醫求助，而中醫往往采用西醫診斷，中醫治療，以及中西醫結合的療法。至於所謂的循證醫學、比較醫學、後現代醫學、行為醫學等“醫學”，還不能稱之為獨立的醫學科學。關於這壹點在靈魂醫學的相關章節會有相關的評論。
總之，世界上以中西醫為主的各種醫學科學都有不完善性，即以不完整的人作為研究對象的醫學科學，因此無法解決中西醫史乃至人文社會科學中存在的所有疑難、模糊的問題，成為阻礙醫學科學進步的羈絆。的確，要想解決中西醫乃至人文社會科學中所有的疑難和模糊問題，顯然超出了中西醫的範疇。我們必須跳出中西醫的理論框架，建立新的醫學理論體系。這個體系所涉及的所有問題，在廣度和深度上都要遠遠超出現有的中西醫理論，要把現有的中西醫理論納入自己的理論框架。為了肩負這壹歷史使命，壹個獨創的生命醫學理論體系——靈魂醫學應運而生。它不僅從宏觀或戰略的角度令人滿意地解釋和解決了人類醫學和人文社會科學歷史上存在的所有困難和模糊的問題，而且使人們得以啟迪人生，不得不重新認識人類自身和人類賴以生存的多維世界。