熱電偶使用壹段時間後，保護管和接線板上的汙垢或鹽渣過多，導致熱電偶電極與爐壁絕緣不良，在高溫時更為嚴重，不僅會造成熱電勢的損失還會引入幹擾，由此產生的誤差有時可達數百度。
2.熱慣性引起的誤差
熱電偶測溫過程實際上是熱電偶與被測介質之間的熱交換過程，達到熱平衡需要壹定的時間。由於熱電偶的熱慣性，儀器的指示值滯後於被測溫度的變化，這在快速測量中尤為突出。因此，應盡可能使用熱電極更細、保護管直徑更小的熱電偶。當測溫環境允許時，甚至可以去掉保護管。由於測量滯後，熱電偶測得的溫度波動幅度小於爐溫波動幅度。測量滯後越大，熱電偶波動幅度越小，與實際爐溫的差異越大。當用時間常數大的熱電偶測量或控制溫度時，雖然儀表顯示的溫度波動很小，但實際爐溫可能波動很大。為了精確測量溫度，應選擇時間常數小的熱電偶。時間常數與傳熱系數成反比，與熱電偶熱端的直徑、材料的密度和比熱成正比。要減小時間常數，除了增加傳熱系數外，最有效的方法是盡量減小熱端的尺寸。在使用中，通常采用導熱性好的材料、薄壁、內徑小的保護套，如高靈敏度的鎧裝熱電偶和采用變徑技術的小型惰性熱電偶產品。在更精確的溫度測量中，使用無保護套的裸線熱電偶，但熱電偶容易損壞，應及時校正和更換。
3.熱阻誤差
壹些高溫爐使用煤或焦油作為燃料。時間長了，保護管上就有壹層煤灰，上面還附著焦炭粉塵，增加了熱阻，阻礙了熱傳導。此時，溫度指示低於測量溫度的真實值。因此，熱電偶保護管的外部應保持清潔。熱電偶側溫度儀表測量誤差的主要來源如下。
1.熱電偶分度誤差
由於熱電偶的材料成分不能嚴格滿足復現性和均勻性的要求，熱電偶熱電特性的實際電位與標準刻度略有出入。
2.由補償線和熱電偶的熱電特性之間的差異引起的誤差。
各種熱電偶補償線的允許誤差範圍如下:
鉑-鉑熱電偶
鎳晶格-鎳矽熱電偶
鎳鉻銅熱電委員會
3.冷端溫度變化引起的誤差
如果用補償電橋進行冷端凹陷補償，熱電偶的電位特性和補償電橋產生的電位只能在20℃或50℃的設計點完全補償，其他溫度由於熱電偶特性的非線性不能完全匹配，會產生壹定的誤差。其他冷端補償的方法，由於流域測量或者其他原因，也會帶來壹些誤差。
4.由於熱電極的退化
如應力分布、氧化等熱電偶出廠後性能變化引起的誤差。
5.絕緣不良導致的誤差
使用熱電偶時，要註意兩個熱電偶電極之間及電極與地之間的絕緣，否則會降低電位，影響測量精度。