邊境地區都有險要的地形，構成了天然的國防防線。與現在相比，當時的氣候更加溫暖濕潤，森林和草原的覆蓋率更高。淮水以南的江南地區屬於濕潤的熱帶叢林氣候，關中地區的森林也很茂密。當時，耐寒的竹子也分布在黃河的渭水地區。
長城壹線約等於15寸等雨量線，成為遊牧和農耕的分界線。北疆長城的意義對後世影響很大。
至於疆域的變化，秦朝的前身是秦國，其疆域春秋時擁有關中地區，戰國時大擴張。到秦趙翔稱王時，秦國擁有關中、漢中、巴蜀、河東、南陽、南郡，幾乎占據了中原的半壁江山。秦王在位時，發動了秦滅六國的戰爭。
每滅壹國，設數郡，分別為潁川郡、邯鄲郡、巨鹿郡、太原郡、遼東郡、代縣。前230年到前225年，韓、趙、魏等國被滅，燕國被破。秦國的勢力擴展到河北和河南。在前225-223年間，楚國和越國相繼滅亡，秦國的勢力擴展到了長江下遊。前222年滅燕國、代國。最後在前221年被消滅。
秦朝建立後，疆域從中原擴展到四方。215年，蒙恬被發配北伐匈奴，奪取河南，建九原郡。修築萬裏長城成為中原王朝的北界。
在南方，閩越投降後，設置閩中郡，並於214年發起秦攻百越之戰，將疆域從長江流域擴展到嶺南地區、南海沿海和越南，設置南海郡、桂林郡和項峻郡，從而達到疆域最大。秦朝滅亡後，由於項羽分封十八諸侯，出現了三秦三齊的地理範圍，成為三楚三晉的秦漢地理範圍。
行政區劃
秦朝的行政區劃是郡縣制，即縣(內史)、縣(道)制。早在戰國末期，秦國等六國就推行郡縣制，但秦的封建食邑在老艾事件後被徹底鏟除。
秦朝曾經兩次提出建立封建制度。有壹次，建國之初，丞相王綰建議，像周朝壹樣，在東方新征服的土地上增聘秦之士為王，壹方面控制地方，壹方面保衛中央。
但李斯認為，幾代之後，國家會變得太大而不能倒，反而會成為帝國的內憂。第二次，儒生淳與周辯論。他希望與商周建立封建國家，認為這樣會像商周不斷保護國家壹樣，遭到李斯的強烈反對，埋下焚書之禍。
秦縣的特點是按自然區域劃分的，各縣大部分以平原或盆地為中心，以山地或高地為邊界。據《史記》記載，建國之初有三十六郡，後來增加到四十八郡，此外還有四十郡五十四郡。由於秦末內亂和楚漢戰爭破壞嚴重，詳細資料不足。