他登上王位後，采取了各種政治手段來鞏固自己的王位。首先是消滅異己，分化瓦解太子集團，把尹貴從西北軍前線召回，並加以取締。
金鳳封尹貴為太子廉，丞相事務大臣。派銀燕到青海西大同(今青海大同西北)。鑒於清朝沒有行之有效的倉儲制度，皇位繼承時常發生糾紛，於是建立了秘密倉儲制度。
雍正元年(1723)，接受陜西巡撫諾敏的建議，實行廢羨還公、守廉錢的措施，以限制和減少官員的貪汙勒索。
第二年，鑒於康熙末年各地錢糧嚴重不足，決定進行壹次嚴格的清查，貪官立即被劫財物，拖欠百姓，並下令短期內收稅。
三年，世宗以跋扈過權、任人唯親為名，下令撫遠將軍年羹堯自殺。同時砍了鼓童太保，後圈封殺常春元不死。因此，王征文西征案和查思庭考題案受到牽連。
七年，曾靜派弟子張西策動川陜總督嶽鐘琪叛亂，牽連了已故理學家呂留良。世宗於是設立文字獄，作為控制思想、打擊政敵、提高權威的手段。
同年，為適應西北作戰需要，設立軍事機要室(十年改為軍部)，選派重要大臣輔佐軍務。軍機大臣只能對皇帝的命令進行解釋，卻無權對畫進行褒揚，從而使皇帝更加集權。除了題書和奏書，他還命巡撫向地方官員下達訓令(密奏早在康熙時期就已試行，但在雍正時廣泛使用)，以加強皇帝對地方行政的控制。雍正帝閱圖采取了壹些旨在發展農業生產的經濟措施。
雍正二年，直隸總督李·開始推行“攤田入畝”制度。同時，他宣布取消儒戶和官戶，限制士紳特權，使勞役負擔不分貧富更加合理。同時，為了解決日益增長的人口所需的糧食問題，更加嚴格地實行傳統的重農抑末政策，鼓勵墾荒，強調糧食生產，反對種植經濟作物，反對開礦和發展手工業(這是封建統治者的局限性)。他重視水利建設。除了在浙江治理黃河、修築海堤之外，他還命令太子項在直隸開發農田水利，在寧夏修築和疏浚運河。與此同時，進行了社會改革。
雍正元年，他下令消滅山西、陜西的樂書，並下令其他廉價書也這樣做。後來，浙江紹興的懶人、安徽徽州的“鏢局”、寧國的仆役、廣東的乞丐、江蘇常熟的乞丐等相繼開門，打擊了殘存的蓄奴制，對社會發展起到了積極作用。
世宗在位期間也註重與少數民族的關系和外交關系。
雍正四年，根據雲貴總督鄂爾泰的提議，建立雍正書房畫冊，大規模實施“改土為流”政策，取消了雲貴、廣西、湖南、四川等省的部分土司，加強了中央政府在這壹地區的統治。
五年間，清廷與俄國締結了《布林斯基條約》和《恰克圖條約》，在劃定中俄邊界和處理兩國貿易問題上維護了國家主權。
清朝世宗把他審閱過的壹些奏折編成《竹皮魚雨誌》。他給朝臣的詔書被張、等輯成內閣體和帝國八旗。
他的各種體裁的文章被後人編入《皇家文集》。雍正十三年，世宗駕崩。獻帝。