軟件開發和加載完成後，開始典型飛針測試流程的測試和調試。調試是測試開發人員的下壹步工作，需要用來獲得最好的UUT測試覆蓋率。調試時，檢查各部件的測試上限和下限，確認探頭的接觸位置和零件值。具有1000個節點的典型UUT調試可能需要6-8個小時。
飛針測試儀開發容易，調試周期短，使得UUT測試程序的開發對測試工程師的需求很少。從收到CAD數據到UUT準備好進行測試的時間很短，這使得制造過程具有最大的靈活性。相反，傳統ICT的編程和夾具開發可能需要160小時，調試需要16-40小時。因為編程簡單，可以在幾個小時內測試原型組裝，測試低成品率的UUT，不需要典型的夾具開發費用，所以飛針測試可以解決生產環境中的很多問題。但並不是所有的生產測試問題都可以用飛針測試來解決。
像任何事情壹樣，飛針測試也有它的缺點。因為測試探針與過孔和測試焊盤上的焊料物理接觸，所以焊料上可能會留下小凹坑。對於壹些OEM客戶來說，這些小坑可能會被認為是外觀缺陷，導致拒收。但目前壹些高端飛針測試設備廠商已經開發出新技術。使用“軟著陸”可以避免在焊料上留下明顯的凹坑，甚至可以在陶瓷芯片上測試。
此外，由於探針有時會接觸到沒有測試焊盤的元件引腳，因此可能會錯過松動或焊接不良的元件引腳。
此外，探針測試儀還限制了電路板的尺寸:不能超過16 24。目前SPEA的最大測試範圍可以達到27' * 24' (686 * 610 mm)。
飛針測試時間是另壹個主要因素。典型的針床測試儀可能需要30秒來測試UUT，而飛針測試儀可能需要8-10分鐘。此外，針床測試儀利用頂部夾具可以同時測試雙面PCB的頂部和底部元件，而飛針測試儀需要操作者測試壹面，然後翻轉過來測試另壹面，這說明飛針測試無法滿足量產的要求。SPEA的測試時間最快可以達到平均每秒20個組件左右(忽略每個組件的高度和距離)。盡管有這些缺點，飛針測試仍然是壹個有價值的工具。其優點包括:快速測試和開發；低成本測試方法；快速轉換的靈活性；並在原型階段為設計師提供快速反饋。所以相對於傳統ICT，飛針測試所需的時間可以通過減少總測試時間來彌補。使用飛針測試系統利大於弊。例如，在裝配過程中，這種系統規定在收到CAD文件後幾個小時就可以開始生產。因此，原型電路板可以在組裝後幾個小時進行測試。與ICT不同，高成本的測試開發和固定可能會將流程延遲幾天甚至幾個月。另外，由於設置、編程和測試的簡單快捷，實際上普通的技術裝配工，而不是工程師，都可以操作測試。還有飛針測試的靈活性，從而實現快速的測試轉換和工藝誤差的快速反饋。還有，因為飛針測試不需要夾具的開發成本，是壹個可以放在典型測試流程前面的低成本系統。而且由於飛針測試儀改變了低產出、快速轉換組裝的測試方式，通常需要數周時間開發的測試，現在幾個小時就可以獲得。