1.不同的目標(定位)
強基計劃？，主要選拔有誌於服務國家重大戰略需求，綜合素質優秀或基礎學科拔尖的學生。突出基礎學科的支撐引領作用，有關高校要結合自身辦學特色，以數學、物理、化學、生物與歷史、哲學、古文字學等相關專業為重點進行招生。高校自主招生和普通大學沒什麽區別。
2.審計方法不同(選擇方法)
強基計劃？拿競賽證書、論文、專利等的做法。由於入圍高校的考核條件被取消，以學生的高考成績為依據。高考是錄取的重要依據。強基是否打算改變原來的自主招生？降分錄取？高校通過這種方式，將考生的高考成績、綜合考試成績、綜合素質評價轉化為綜合成績，從高到低依次錄取，體現了對學生更全面、更綜合的評價。而且高考成績的比重不能低於85%，也就是說從今年開始，高考成績變得格外重要。
3.不同招生專業
強基計劃突出基礎學科的支撐引領作用，自主招生不限制高校招生專業範圍。
總的來說，強基計劃和自主招生有很多區別，比如選拔定位不同，招生專業不同，入學考試依據不同，錄取方式不同，培養模式不同。強基計劃更註重高考成績，更公平，註重人才培養。所以這種新的招生方式取代了原來的自主招生，我也相信以後會有更多更公平更完善的招生方式。