純債券過戶:僅用於現券交易結算，是指買賣雙方在不通知其資金結算的情況下，要求中央結算公司在結算日辦理債券交割過戶的結算方式。國際證券業將這種方式稱為FOP(FreeofPayment)，即無資金結算條件的債券轉讓。這種方法可以用在結算成員雙方都有良好的信譽並且互相了解的情況下。如果選擇這種結算方式，各方不得以未收到對方的券或款為由，不如期履行交割義務。
即期付款:用於即期債券交易和封閉式回購第壹階段的結算。是指在結算日，買方/逆回購方通過債券簿記系統得知賣方/逆回購方有足夠的債券履行義務，即向對方劃轉款項，然後通知中央結算公司辦理債券結算的方式。是買方\逆回購方主動參與的壹種結算方式。賣家/買家在選擇這種方式時，要充分考慮對方的信譽。
付款後交割:用於即期債券交易和封閉回購的到期交割。是指賣方/逆回購方在結算日確認收到買方/回購方的資金後，通知中央結算公司辦理債券結算的壹種方式。是賣方/逆回購方主動參與的壹種結算方式。如果買方信任賣方，可以使用。
處理證券支付:指債券與資金在結算日同步結算，互為結算條件的方式。國際證券業稱之為DVP(DeliveryVersusPayment)。壹般需要債券結算系統和資金劃轉結算系統對接，同步處理債券和資金的結算。根據國際同行業經驗，債券簿記系統和支付系統連鎖運行，同時劃轉債券和資金，配合相應的質押融資融券機制，實現實時高效的DVP。隨著我國大支付體系的發展，現在大部分金融機構都采用憑證處理結算方式。