壹、從商業公司采購
從商業公司處采購這壹采購模式最為傳統，也最為常見。由於連鎖藥店發展的不均衡性，銷售額普遍不高，加之營銷成本的考慮，很少有生產企業會與連鎖直接開戶合作，連鎖為了保證銷售品類的齊全，只有從商業公司進行壹站式采購。該模式的優點在於保證了品類更加齊全，且由於商業公司壹般都駐紮當地，配送力較強，連鎖藥店采購效率也會更高。
缺點：從商業處采購的最大問題是藥品的購進價格已經包含配送費，無法保證價格優勢，而且與生產企業接觸也不是很緊密，生產企業提供的增值服務較少，加之現在生產企業對渠道控制比較嚴格，暢銷產品的貨源也得不到保障，斷貨現象經常出現。
二、從生產企業直接采購
隨著壹部分大型連鎖藥店經過競爭、整合、並購後規模逐漸擴大，網絡逐漸健全，銷售額已經可以與壹些商業公司相媲美，連鎖藥店的話語權開始增強，壹些生產企業為了縮短供應鏈，開始與大型連鎖藥店直接開戶合作。
從生產企業直接采購的優勢是減少了中間的商業環節，節省了商業配送費，能夠從生產企業拿到比商業公司更優惠的價格，從而增加利潤率，而且與生產企業的直接交流，合作粘性增強，獲得的增值服務會更多。也有壹些連鎖藥店會以區域代理商的身份從生產企業直接進貨，從而形成銷售高毛或貼牌產品現象。
缺點：從生產企業采購的問題是，品牌產品企業由於銷售量比較大，對資金要求比較嚴格，覆蓋終端也較多，為節約人力成本，壹般不願意和連鎖藥店直接合作，與連鎖藥店直供的大多是中小企業，導致這種直采模式很難采購到品牌產品。
三、連鎖藥店聯盟統壹采購
連鎖藥店聯盟統壹采購是近年較為流行的采購模式，壹些連鎖藥店在掌握了局部終端資源後，為了進壹步從生產企業獲得資源，多家連鎖藥店會組成聯盟，優勢疊加，提高話語權，與生產企業進行談判，目的是以更大的銷售規模和更大的終端網絡來獲得生產廠家的獨家規格產品和更低的價格，從而增加連鎖藥店的利潤。
缺點：藥店聯盟采購的主要目的是以規模換價格，但是藥店聯盟存在的最大問題是管理比較松散，雖然網絡比較廣，銷售基數也很大，但是在後期門店營銷執行層面偏弱，無法給生產企業量的保證。如果沒有量的保障，對生產企業其實是壹種傷害，後期的采購與合作很難持續。
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