糞便全收集還田模式
養豬場產生的糞尿汙水集中收集，全部儲存在氧化塘內，氧化塘分為敞開式和覆膜式。糞便儲存在氧化池中進行無害化處理，並在施肥季節用於農田。
主要優點是:糞便收集、處理和貯存設施建設成本低，處理和利用成本也低；糞便和汙水全部收集，養分利用率高。
主要缺點:糞便貯存期壹般在半年以上，需要足夠的土地建設氧化塘貯存設施；施肥期相對集中，需要配套專業化的攪拌設備、施肥機械和農田施藥管網；糞便長途運輸成本高，只能在壹定範圍內使用。
適用範圍:適用於養豬場水泡糞工藝，糞便總固體含量小於15%；需要與糞肥中的養分數量相匹配的農田。
固體肥料堆肥利用模式
主要使用養豬場的固體糞便，經過好氧堆肥後，在當地農田使用或生產有機肥。
主要優點:好氧發酵溫度高，糞便無害化處理徹底，發酵周期短；堆肥提高了糞便的附加值。
主要缺點:好氧堆肥過程容易產生大量臭氣。
適用範圍:適用於只有固體肥料，沒有汙水的農場。
異位發酵床模式
在傳統發酵床養殖的基礎上，墊料不與豬直接接觸，豬圈免沖洗。糞便和尿液通過漏雨地板進入下層墊料或轉移到棚外帶墊料的發酵罐中進行發酵分解和無害化處理。壹段時間後，糞便和尿液可直接用作農田的有機肥料。
主要優點:飼養過程中不產生汙水，處理成本低。
主要缺點:墊料購買難以大面積推廣；糞尿混合含水量高，發酵分解時間長，在寒冷地區使用受限；高架發酵床豬圈建設成本高。
適用範圍:主要適用於南方水網地區農田有限的養豬場，其中屋外發酵床適用於年產1000 -2000的養殖場，高架發酵床適用於規模化養殖場。
用農生樂微生物發酵劑發酵豬糞生產有機肥的方法:
1)發酵原料:如谷殼、雜草、人畜糞便、農作物稭稈(切碎)、莖葉、鋸末、食用菌基質殘渣和餅粕等。
2)工具:攪拌機；塑料容器或水泥池(或坑上塑料薄膜)；塑料薄膜；破碎機(普通農用型)；鏟子。
3)發酵菌:農生樂微生物發酵劑。
4)比例:谷殼、雜草、人、畜、禽糞便、農作物稭稈(切碎)、莖葉、鋸末、食用菌基質殘渣和餅粕等。200kg材料:農生樂微生物發酵劑1kg。
5)操作程序:
(1)按比例準備200公斤發酵原料，作為發酵原料備用；
②將1 kg農生樂微生物發酵劑倒入50 kg水中，稀釋攪拌均勻，稀釋水最好是井水或河水。如果是自來水，請放置24小時後再使用；在裏面適當溶解壹些紅糖比較好。
(3)如果有攪拌器，可將發酵原料攪拌2分鐘，然後倒入發酵劑稀釋液攪拌6分鐘；無攪拌器:按由少到多的原則用鏟子攪拌，即先將稀釋後的菌液倒入少量發酵原料中攪拌均勻至無結塊，再將攪拌好的少量發酵原料倒入剩余發酵原料中攪拌均勻至無結塊；(註:根據發酵原料的幹濕程度增減稀釋水量，使用稀釋的菌液。
水要占發酵原料的40%左右，用手揉成壹團。如果透過手指看到水卻不滴水，不如放手。註意:水太多容易酸，太少發酵不徹底。如果發酵原料是濕的，稀釋用水要減少。)
(4)將混合好的發酵原料放入塑料容器或水泥池(或坑內塑料薄膜)，最後填實壓實，排氣後用塑料薄膜密封。適宜溫度25-35℃，發酵持續5-10天(壹般夏季4天，春秋7天，冬季10天)。註意溫度和時間的控制。