壹、歷史淵源
農村商業銀行由農村信用社改制而成，而城市商業銀行壹般由成立於上世紀80年代的城市信用社改制而成，其歷史沿革與農村商業銀行相似。
第二，獨立性
農商行的獨立性是最差的，除了少數銀行，壹般都是省聯社限制。
城商行相對獨立，但由於大部分由當地市政府控股(部分由省政府控股)，壹般都要聽政府的。但是，政府畢竟不是專門管理銀行的，壹般是管理人事任免的。
第三，規模
除了北京農商行和上海農商行，壹般農商行的規模會小於城商行。
第四，業務能力
農村商業銀行業務能力普遍較差，既有自身原因，也有監管因素。
他們自身的原因是，農村商業銀行起步晚，規模小，體制混亂，存在過去拖累不好，員工“世襲”等諸多問題。監管因素是銀監會壹直不願意把農商行做大，對其機構和產品有很多限制。
城商行的業務能力參差不齊，但總體上比農商行好。城商行的業務優勢是離當地近，審批流程短，機制靈活。在地方政府的支持下，很多城商行不僅在當地做得很好，還在異地開設分行。此外，在同業市場，城市商業銀行近年來異軍突起，是暴利業務的壹大主力。延伸資料:農村商業銀行農村商業銀行是發展到壹定程度的農村信用社。是由農戶、農村工商戶、企業法人和其他經濟組織組成的股份制地方金融機構。發起人主要是原農村信用社的股東。
城市商業銀行。是城市信用社發展到壹定程度。城市商業銀行是我國銀行業的重要組成部分和特殊群體。從80年代初到90年代，全國有5000多家城市信用社。然而，隨著我國金融業的發展，城市信用社在發展過程中逐漸暴露出許多風險管理方面的問題。許多城市信用社逐漸轉型為城市商業銀行，為地方經濟和當地居民提供金融服務。發起人主要是原城市信用社的股東。