1.標本:尿液、血液、膿液、腦脊液等。取自腸外感染患者的中段，糞便取自腹瀉患者。
2.分離、培養和鑒定:糞便標本直接接種腸桿菌選擇性培養基。血液需要先用肉湯增菌，再轉移到血瓊脂平板上。其他標本可同時接種血瓊脂平板和腸桿菌選擇性培養基。
37℃孵育65438±08 ~ 24h後，觀察菌落，塗片鏡檢。用壹系列生化反應進行鑒定。致病性大腸桿菌需要進行血清分型試驗。如有必要，檢測腸毒素。
除了確定泌尿系統大腸桿菌外，還應計數。只有每毫升尿液的細菌含量≥100000才具有診斷價值。
二、衛生細菌學檢查
大腸桿菌不斷隨糞便排出，汙染周圍環境、水源、食物等。抽樣檢驗時，樣本中大腸桿菌越多，樣本被糞便汙染越嚴重，樣本中存在腸道致病菌的可能性越大。因此，應對飲用水、食品和飲料進行衛生細菌學檢查。
1.細菌總數:檢測每毫升或每克樣品中所含的細菌數，通過傾註培養計算。我國規定的衛生標準是每毫升飲用水細菌總數不得超過100。
2.大腸菌群計數指標:指每升的大腸菌群數，用乳糖發酵法檢測。我國的衛生標準是每1000ml飲用水大腸菌群不得超過3個；瓶裝汽水、果汁等。每100毫升不得超過5個大腸菌群。
三、全自動微生物定量分析儀(TEMPO)檢測
自動微生物定量分析儀檢測大腸菌群有TC法和CC法兩種。開發TEMPOTC是為了獲得與NFISO4832標準相當的性能水平。
TEMPOCC法是根據BAM法在TEMPO儀器上24小時計數食品中大腸菌群的特殊方法。本法律的目的是獲得與AOAC官方方法966.24和美國公共衛生協會乳制品檢測(SMEDP)相同的效果。TEMPO system根據陽性空白的大小和數量計算原始樣本中大腸菌群的數量。
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擴展數據:
多管發酵是檢測水中大腸桿菌的傳統方法。這種方法是在含有熒光底物的培養基上於44.5℃連續培養24小時，然後產生葡糖醛酸酶，葡糖醛酸酶分解熒光底物，從而釋放出熒光產物，再使培養基在紫外照射下產生特征熒光。
該方法可用於統計估計原始樣本中的菌落數。
壹般涉及以下試驗:首先，在單或雙乳糖膽鹽發酵管中進行發酵；然後進行分離培養實驗，用伊紅亞甲藍培養皿分離；然後在乳糖發酵管中進行第二次發酵，最後通過孢子染色、革蘭氏染色和顯微鏡觀察完成。
多管發酵法對檢測條件要求低，成本低，但檢測時間長，易受其他條件幹擾，進壹步影響測定結果的準確性。
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