1，定位不同。微信官方賬號服務於營銷和信息傳遞，小程序面向產品和服務。
微信官方賬號主要用於信息傳遞，實現人與信息的連接，主要輔以營銷、信息傳遞等簡單服務，而小程序在功能上與微信官方賬號嚴格區分，包括不支持關註、消息推送等營銷手段。壹方面，產品和服務不淹沒在微信官方賬號的營銷信息中，另壹方面，支持微信官方賬號、朋友圈、群組、小程序之間的互動和導流，讓開發者可以專註於產品和服務，從而為微信帶來大量的長尾服務，疊加微信自身的重服務，構建從社交到社交。
2.意識到技術差異。微信官方賬號基於H5，小程序基於微信自身的開發環境和語言。
小程序是微信裏的雲應用，不需要安裝。不是原生APP，但實現了接近原生App的體驗。
微信官方賬號是基於傳統的H5開發運行的，是壹個瀏覽器，微信小程序不是壹個完整的瀏覽器。在開發過程中，使用了與H5相關的技術。微信小程序是基於瀏覽器內核完全重構的內置解析器。它專門針對小程序進行了優化，並配合其自己定義的開發語言標準(基於H5進行了優化)來提高小程序的性能。
3.功能不同。微信官方賬號功能圍繞信息展示和營銷，小程序面向產品和服務。
微信和微信官方賬號在開發語言、設計規範、營銷模式、審核機制等功能上有很大不同。微信官方賬號是賬號的壹種類型，為用戶提供發布信息和咨詢的平臺，提供新的信息傳播方式，與讀者建立更好的溝通和管理模式。繼H5之後，微信官方賬號也可以提供壹些簡單的互動功能。小程序主要是提供服務，比微信官方賬號中的更流暢，可以提供更復雜的產品和服務。微信官方賬號的功能主要以信息傳遞和營銷為主。小程序嚴格控制營銷功能，以區別於微信官方賬號，讓小程序的服務體驗和便捷性得以提升，不會淹沒在微信官方賬號的過度營銷信息中。
4.體驗上的差異。微信官方賬號操作延遲長，小程序體驗接近原生app。
微信官方賬號中點擊應用功能後需要壹段時間才會出現綠色的進度，業務邏輯復雜、交互要求高的應用體驗較差。而且小程序會非常流暢，幾乎不用等待，像普通APP操作壹樣流暢。
隨著時間的推移，小程序的普及率越來越高，小程序也越來越成熟。總有壹天，小程序會以其強大的功能和影響力征服所有人。