(2)鴨病防疫不規範。近年來，禽流感、雛鴨肝炎、鴨漿膜炎、大腸桿菌等疾病給我國養鴨業造成了巨大的經濟損失。疾病危害肉鴨的健康，降低肉鴨的生產性能和水產養殖的經濟效益。為了防控肉鴨疾病，養殖戶濫用獸藥，使肉鴨產品的衛生安全得不到保障，給食品安全帶來隱患，危害人體健康。所以要堅持預防為主，防重於治的原則，定期消毒，增強免疫力。鴨舍及其周圍環境、水池、運動場要定期消毒。消毒劑要經常更換，防止產生耐藥性。免疫是防止肉鴨疫病發生的重要技術措施。各地要根據流行性疾病的流行特點制定免疫程序，嚴格按照免疫程序接種疫苗，防止疾病的發生。
(3)飼料質量差飼料成本占養殖生產總成本的65%以上，是肉鴨養殖經濟效益的關鍵。但由於我國尚未建立肉鴨營養需要量標準，很多飼料企業根據自己的經驗制作飼料，導致肉鴨飼料不穩定，質量往往較差，給養殖場造成損失。因此，為肉鴨的生長提供營養均衡的配合飼料是發展肉鴨產業的重要保證。
(4)環境汙染嚴重的肉鴨養殖企業或養殖戶環保意識不強，隨意在養鴨場周圍、道路沿線、村莊或直河中堆放糞便，造成水質汙染和環境惡化。
(5)鴨制品加工技術落後。我國的鴨產品雖然豐富多樣，但大多是傳統手工作坊加工。由於加工手段和技術落後，生產的產品檔次低，不能完全滿足現代消費和出口的需要。