運轉過程中，電機主軸始終與葉輪保持間隙。與傳統機組相比，降低了電機損耗、變頻損耗、齒輪損耗和軸承損耗，從而提高了運行效率，具有明顯的節能優勢。
普通離心式壓縮機由電機通過傳統的軸承傳動驅動，磁懸浮離心式壓縮機由永磁電機驅動。正是由於這種工作原理，磁懸浮離心式冷水機組具有很大的優勢。
1，節能:在部分負荷運行的情況下，峰值效率COP高達12。根據通用空調系統全年運行統計，與其他冷水機組相比節電率高達35%。
2.日常維護費用低:磁懸浮單元系統運動部件少，沒有復雜的油路系統和油冷系統的濾油器，不需要每年清洗主機，只需要對蒸發和冷凝器水垢進行處理和清洗。蒸發冷凝器壹次清洗費用為0.1~0.2萬，可以節省維修時間，避免在用冷需求高峰期清洗機組帶來的不便。
3.運行時噪音和振動低:磁懸浮機組沒有機械摩擦，而是有氣墊阻隔振動，所以機組產生的噪音和振動極低，壓縮機噪音低於77dB，不需要阻尼墊或彈簧阻尼器和隔音室。
4.無摩擦損失:無機械軸承和齒輪，無機械摩擦損失，無潤滑油循環，純制冷劑壓縮循環，不加熱或冷卻潤滑油。與傳統離心軸承的摩擦損失相比，磁力軸承的摩擦損失僅為前者的2%左右。
5.啟動電流小:常規的大螺桿機組配有大電機，啟動瞬間會產生很大的沖擊電流，壹般達到200A-600A，會影響電網的穩定性，所以設計電網時必須考慮保護措施。而磁懸浮機組的啟動過程采用壓縮機變頻軟啟動的方式，使得啟動電流低至6A，因此啟動電流小，對電網的影響低，在電網設計中不需要特別的保護考慮。
6.系統可持續性高:即使每年清洗常規大螺桿機組系統中的油，由於潤滑油的殘留和積累，能效損失也會高達25%，導致系統換熱效率差，機器負荷重，但冷卻效果不佳，運行周期越長，效率降低越明顯。磁懸浮單元是無油運行的，所以不會有潤滑油殘留和控制的問題，所以隨著運行壽命的增加，也不會有潤滑油造成效率損失的問題。