第壹，性質不同
1，漁政
漁政是依據漁業法律法規對國家管轄範圍內的漁業、漁業水域和水產資源進行的行政監督管理。
2，海監，
海監管理是依據有關法律法規，對國家管轄海域(含沿海)實施巡航監視。
第二，主要職責不同
1，漁政
(1)、監督檢查漁業法律法規的執行情況。
(2)向同級或上級漁業行政主管部門提出漁業資源狀況和有關事項的建議。
(3)、負責審查和發放捕撈許可證。
(四)監督檢查國際漁業協定的執行情況，協助有關部門處理漁業行政管理中的涉外事宜。
⑤維護漁業生產秩序，協助有關部門處理漁業生產糾紛。
⑥協助有關部門維護漁業水域生態環境，保護珍貴稀有水生動植物。
2.海上監視
(1)、制定並組織實施海洋執法監督工作計劃。
(2)、制定海監經費使用計劃，監督管理業務經費的使用。
(3)、建設和管理海監隊伍，制定海洋執法和監督的規章制度。
(四)組織協調管轄海域的海洋執法監督工作，發布海洋執法監督公報和通告。
⑤組織重大海上事件的應急監測、調查和取證，並依法調查處理。
6、建設和管理海洋監測網絡，管理海洋執法和監督信息。
⑦、建設和管理海洋執法監管技術支撐體系，組織制定海洋執法監管技術規範和標準。
(八)承擔海洋監察員的資格管理和培訓，頒發海洋監察員證書。
⑨、制定並組織實施海監船舶、飛機和裝備物資的配備維護計劃，並監督中國海監船舶和飛機的安全。管理海監隊伍的部署和使用。
⑩、監督管理海監船舶、飛機炫號和海監人員著裝、標誌使用。
第三，管理對象和範圍不同
1，漁政
管理對象包括個體漁業生產者、漁業生產組織和其他漁業社會組織，漁業資源，漁業水域生態環境，漁船、漁具等漁業生產資料，魚、蝦、蟹等漁業生產的產品。
2.海上監視
管理範圍包括根據委托或授權，查處侵犯海洋權益、非法使用海域、破壞海洋環境和資源、破壞海上設施、擾亂海上秩序等行為，以及其他海上執法工作。
百度百科-漁政管理
百度百科-中國海監總隊