零基預算的優點如下：
1、有利於提高員工的“投入壹產出”意識。傳統的預算編制方法，主要是由專業人員完成的，零基預算是以“零”為起點觀察和分析所有業務活動，並且不考慮過去的支出水平，因此，需要動員企業的全體員工參與預算編制，這樣使得不合理的因素不能繼續保留下去，從投入開始減少浪費，通過成本—效益分析，提高產出水平，從而能使投入產出意識得以增強。
2、有利於合理分配資金。每項業務經過成本—效益分析，對每個業務項目是否應該存在、支出金額若幹，都要進行分析計算，精打細算，量力而行，能使有限的資金流向富有成效的項目，所分配的資金能更加合理。
3、有利於發揮基層單位參與預算編制的創造性。零基預算的編制過程，企業內部情況易於溝通和協調，企業整體目標更趨明確，多業務項目的輕重緩急容易得到***識，有助於調動基層單位參與預算編制的主動性、積極性和創造性。
4、有利於提高預算管理水平。零基預算極大地增加了預算的透明度，預算支出中的人頭經費和專項經費壹目了然，各級之間爭吵的現象可能緩解，預算會更加切合實際，會更好得起到控制作用，整個預算的編制和執行也能逐步規範，預算管理水平會得以提高。
零基預算的缺點
1、由於壹切工作從“零”做起，因此采用零基預算法編制工作量大、費用相對較高。
2、分層、排序和資金分配時，可能有主觀影響，容易引起部門之間的矛盾。
3、任何單位工作項目的“輕重緩急”都是相對的，過分強調項目，可能是有關人員只註重短期利益，忽視本單位作為壹個整體的長遠利益。