魏晉南北朝時期，我國傳統的醫藥學進入壹個廣泛總結整理的階段。晉代名醫王叔和除整理張仲景的《傷寒雜病論》外，還對歷史上的脈學著作進行了系統的歸納，撰成我國現存最早的脈學專著《脈經》10卷，書中列舉了24種脈象，對每壹種脈象都作了簡明扼要的概述，中醫學中獨特的針灸治療技術，亦由晉代的皇甫謐總結為《針灸甲乙經》12卷，全書分118篇，記述單穴49個、雙穴300個，***349個經穴，並具體指明了針刺深度、留針時間和艾灸時間，是我國現存最早的針灸學經典著作。另外，此期還出現了西晉葛洪的《肘後方》，南齊陶弘景的《神農本草經集註》，劉宋雷教的《炮炙論》等著名醫著，前兩者流傳至今，後者僅有輯佚本傳世。