保護皖南古村落應從以下幾點做起：自然生態保護、建築遺產保護、歷史文脈保護、人口社會保護等。
1、自然生態保護
古村落的旅遊就是建立在自然風光和建築和諧統壹的基礎上的，壹旦自然環境遭到破壞，壹切將無從談起。配套設施應符合皖南的建築風格和習慣，開發具有皖南地方特色的旅遊項目，為人們提供回歸自然的度假項目和服務。
2、建築遺產保護
要求我們在其原始性和真實性指導下保護原來真實的東西，對其的維修並不能按照當今我們的觀念來進行重建，堅持修舊如舊的原則，不斷滿足村民改善生產生活條件的需求。恢復的古村落爭取做到文化見證人和文化傳承人的指導性認可，保持村落文化的原真性和價值性。
3、歷史文脈保護
對於散落在民間的故事傳說，習俗禮儀，民間藝人，都需要充分挖掘並加以保護，可建造壹個古村落博物館，將有價值的物質非物質文化遺產收集起來展示給世人欣賞學習。
4、人口社會保護
壹個完整的古村落不單單是有特色的建築，更重要的是由當地的村民居住所產生的壹系列的社會生活所產生的。合理地調配合理利用資源，對傳統村落的不可再生資源進行保的同時，對傳統村落的可再生資源進行合理管理。
皖南古村落的建築價值：
古宏村人規劃、建造的牛形村落和人工水系，是建築奇觀：巍峨蒼翠的雷崗為牛首，參天古木是牛角，由東而西錯落有致的民居群宛如龐大的牛軀。引清泉為“牛腸”，經村流入被稱為“牛胃”的月塘後，經過濾流向村外被稱作是“牛肚”的南湖。
人們還在繞村的河溪上先後架起了四座橋梁，作為牛腿。這種村落水系設計，不僅為村民解決了消防用水，而且調節了氣溫，為居民生產、生活用水提供了方便，創造了壹種“浣汲未防溪路遠，家家門前有清泉”的良好環境。全村現保存完好的明清古民居有140余幢，古樸典雅，逸趣橫生。