1、酚抽提法：先用蛋酶K、SDS破碎細胞，消化蛋白，然後用酚和酚-氯DNA大小為100-150kb
2、甲酰胺解聚法：破碎細胞同上，然後用高濃度甲酰胺解聚蛋白質與DNA的結合，再透析獲得DNA可得DNA200kb左右。
3、玻璃棒纏繞法：用鹽酸胍裂解細胞，將裂解物鋪於乙醇上，然後用帶鉤或U型玻璃棒在界面輕攪，DNA沈澱液繞於玻棒。生成DNA約80kb。
4、異丙醇沈澱法：基本同1法，僅用二倍容積異丙醇替代乙醇，可去除小分子RNA（在異丙醇中可溶狀態）
5、表面活性劑快速制備法：用Triton X-100A或NP40表面活性劑破碎細胞，然後用蛋白酶K或酚去除蛋白，乙醇沈澱或透析。
6、加熱法快速制備：加熱96℃-100℃，五分鐘，然後離心後取上清，可用於PCR反應。
7、堿變性快速制備：先用NaOH作用20分鐘，再加HCI中和，離心後取上清，含少量DNA。
二、DNA的濃縮（精提取）
1、固體聚乙二醇（PEG）濃縮：用透析袋外敷PEG至合適量。
2、丁醇抽提濃縮：DNA溶液中水可分配到正丁醇或仲丁醇，但DNA不會。因此重復幾次可顯著減少DNA體積。
3、乙醇或異丙醇沈澱：（1）需要陽離子鹽的存在，NaAc最常用,NaCl對含SDS樣品好，NH4Ac去除dNTP好。PiCl沈澱RNA好，但不能用於反轉錄前。（2）沈澱溫度與時間；0℃壹4℃，12000g，10分鐘，小於100bp DNA需超速離心。
4、精胺沈澱法：與DNA結合後使DNA結構凝縮沈澱，需在無鹽或低鹽溶液。