前處理：堆肥原料運到堆場後，經磅秤稱量後，送到混合攪拌裝置，與廠內生產、生活有機廢水混合，加入復合菌，並按原料成分粗調堆肥料水分、碳氮比，混合後進入下壹工序。
壹次發酵：將混合好後的原料用裝載機送入壹次發酵池，堆成發酵堆，采用風機從發酵池底部往上強制通風，進行供氧，同時2天左右進行翻堆，並補充水分（主要以廠內生產、生活有機廢水為主）和養分，控制發酵溫度在50C～65C，進行有氧發酵，本工程壹次發酵周期為8天，每天進壹池原料出壹池半成品，發酵好的半成品出料後，準備進入下壹工序。
後處理：進壹步對堆肥成品進行篩分，篩下物根據水分含量高低分別進行處理。篩下物造粒後，送入由沼氣池沼氣供熱的烘幹機，進行烘幹，按比例添加中微量元素後攪拌混合後制成成品，進行分裝，入庫待售。篩上物返回粉碎工序進行回用。