在流水線生產模式中，由於硬體設備的位置相對固定，設計生產流程時必須基於現有的Layout做設計，對於少量多樣的產品，往往由於Layout的限制，無法實現最優化的生產制程。而精益生產則可以根據不同產品的需要，隨時調整Layout。流水線是規模化生產的產物，追求的是單壹產品或同類產品的效率最大化，Cycle Time壹般設定較快，對於少量多樣的產品，工廠不得不做出兩難的選擇：或是忍受頻繁的換線帶來的效率損失，有時甚至出現前壹個訂單的第壹臺產品還沒有流到最後壹個生產站別，下壹個訂單已經開始生產的狀況；或是壹次性生產較長時間的產品，忍受大量的庫存。精益生產則通常使用較少的人力，較長的cycle time來完成工作，可以大大降低換線的頻率與減少換線的時間。
而另壹方面，對於產品穩定，換線頻率低的產品，傳統流水線則具有壹定的優勢——細致的分工，配合IE對線平衡的不斷改善，可以在短時間內實現生產效率的迅速提升，而且在傳送帶速度的控制下，能確保生產效率的長期穩定。所以，市場需求變化頻繁的產品，較適合於精益生產，而對於市場需求穩定，產品類型單壹企業，則相對更適合采用流水線生產。