(1)直接法：①優點：操作簡便、特異性強、非特異性熒光幹擾因素少；②缺點：敏感性偏低，每檢查壹種抗原需制備相應的特異熒光抗體。
(2)間接法：①優點：敏感性高於直接法，制備壹種熒光抗體可用於檢測多種抗原或抗體；②缺點：參與的因素多，易出現非特異性熒光，操作時間較長。
(3)補體結合法：①優點：敏感性高，制備壹種熒光抗體可檢測多種抗原或抗體，適用任何動物的抗原抗體系統；②缺點：易出現非特異性熒光染色，每次試驗都需要新鮮補體，操作復雜。