中醫理論來源於對醫療經驗的總結及中國古代的陰陽五行思想。其內容包括精氣學說、陰陽五行學說、氣血津液、藏象、經絡、體質、病因、發病、病機、治則、養生等。早在兩千多年前，中醫專著《黃帝內經》問世，奠定了中醫學的基礎。時至今日，中國傳統醫學相關的理論、診斷法、治療方法等，均可在此書中找到根源。
中醫具有完整的理論體系，其獨特之處，在於“天人合壹”、“天人相應”的整體觀及辨證論治。主要特點有：
認為人是自然界的壹個組成部分，由陰陽兩大類物質構成，陰陽二氣相互對立而又相互依存，並時刻都在運動與變化之中。在正常生理狀態下，兩者處於壹種動態的平衡之中，壹旦這種動態平衡受到破壞，即呈現為病理狀態。而在治療疾病，糾正陰陽失衡時並非采取孤立靜止的看問題方法，多從動態的角度出發，即強調“恒動觀”。
認為人與自然界是壹個統壹的整體，即“天人合壹”、“天人相應”。人的生命活動規律以及疾病的發生等都與自然界的各種變化（如季節氣候、地區方域、晝夜晨昏等）息息相關，人們所處的自然環境不同及人對自然環境的適應程度不同，其體質特征和發病規律亦有所區別。因此在診斷、治療同壹種疾病時，多註重因時、因地、因人制宜，並非千篇壹律。
認為人體各個組織、器官***處於壹個統壹體中，不論在生理上還是在病理上都是互相聯系、互相影響的。因而從不孤立地看待某壹生理或病理現象，頭痛醫頭，腳痛醫腳，而多從整體的角度來對待疾病的治療與預防，特別強調“整體觀”。 氣是構成天地萬物的原始物質。
氣的運動稱為“氣機”，有“升降出入”四種形式。由運動而產生的各種變化，稱為“氣化”，如動物的“生長壯老已” ，植物的“生長化收藏”。
氣是天地萬物之間的中介，使之得以交感相應。如：“人與天地相參，與日月相應”。
天地之精氣化生為人。 陰陽是宇宙中相互關聯的事物或現象對立雙方屬性的概括。最初是指日光的向背，向日光為陽，背日光為陰。
陰陽的交互作用包括：陰陽互生、陰陽交感、對立制約、互根互用、消長平衡、相互轉化。 五行學說是中國古代哲學的重要成就，五行即木、火、土、金、水，但是這並不代表五種物質，而是五種屬性。
五行於中醫則體現了具備這五種屬性的人體五大系統的相互關系。木火土金水這五個符號分別代表肝心脾肺腎所統領的五大系統。中醫不是研究微觀的病毒細菌如何作用於人體的理論而是研究人體整體的各個系統之間的關系，並且通過中藥，按摩，針灸，甚至心理作用去調節各個系統之間的平衡，以此保持身體健康。
五行的交互作用包括：相生、相克、制化、勝復、相侮、相乘、母子相及。 藏：指人體內的五臟六腑、奇恒之府，通稱為臟腑。象：壹指“形象”，即臟腑的解剖型態；二指“征象”，即臟腑表現於外的生理病理；三指“應像”，即臟腑相應於四時陰陽之象。
透過外在“象”的變化，以測知內在“藏”的生理病理狀態，稱為“從象測藏”。即“視其外應，以知其內臟”。
“臟腑”不單是解剖型態的概念，而是包括解剖、生理、病理在內的綜合概念。
五臟：指肝、心、脾、肺、腎，壹般籠統功能為“化生和儲藏精氣”。
六腑：指膽、胃、大腸、小腸、膀胱、三焦，壹般籠統功能為“腐熟水榖、分清泌濁、傳化糟粕”。
奇恒之府：指“腦、髓、骨、脈、膽、女子胞”。 三元理論認為：“疾病萬千，不離三元。何謂三元？毒郁虛”。
三元醫學理論認識疾病，認為世界的萬千疾病的病因、病機、辯證、治療，不離三個字：“毒郁虛”。
毒就是有熱了，上火了，血熱了，濕熱，傷風、傷寒了。有菌性炎癥、無菌性炎癥，造成身體的腫脹、滲出、疼痛和器官損害壞死變性的改變。
郁就是身體的各種不流行、不通暢、即郁滯不通。包括氣、血、痰、濕、食、水在體內造成的不暢或堵塞。氣滯則脹，血滯則青或疼痛，痰阻則難咯或出現神誌病變，濕盛則沈重，食積則不消，或大便艱。水停則脹如腹水。
虛就是不足，即氣血陰陽的不足。氣虛無力，血虛則無華色，陽虛則外寒，陰虛則內熱。
世界的萬千疾病 ，有毒了，不通了，虛弱不足了，除此三者，沒有別的病。無毒無虛腑臟經絡通暢，則無病。這就是武學文中醫主任醫師的“三元醫學理論”。
人是壹個有機的整體，人和自然有著密切的關系。這就是醫學的整體觀念，治病時辨證論治，要分清毒郁虛，提綱挈領地認識疾病。整個自然界是壹元，壹元產生陰陽二氣（即自然界相互對立又依存著的兩種屬性，並且在壹定條件下可以互相轉化）。從陰陽的二元論到毒郁虛的三元論，才更適合指導疾病的診斷和治療。三元論能統領疾病的各種辨證方法（陰陽辨證、臟腑辨證、氣血津液辨證、八綱辨證、經絡辨證、六經辨證、衛氣營血辨證、三焦辨證等。）任何以壹種辨證方法和其它辨證方法割裂開來，或者以壹種經典理論（如六經辨證）來限制和阻止其它醫學理論的發展，都是非常錯誤和不得人心的。
三元醫學理論的毒郁虛之間，也存在不可分割的辨證關系。也不能把毒郁虛完全割裂開來。即毒中有郁有虛，郁中也有毒有虛，虛中也可以有毒有郁。即妳中有我，我中有妳，或者三中有壹，或者三中有二，才能完整系統的認識疾病。