首先，兩者的組織者不同
1.省級期刊主辦單位:省級期刊由各省、自治區、直轄市的部、委、廳、局、研究所、省級社會團體和事業單位、大專院校主辦。
2.全國性期刊主辦單位:由中共中央、國務院及其所屬部門或中國科學院、中國社會科學院、民主黨派、全國性人民團體主辦。
第二，兩者的性質不同
1.省級期刊性質:國內外出版的學術期刊。
2.國家級期刊的性質:國家級核心期刊。
第三，兩者的主管單位不同。
1，省級期刊主管單位:省級單位主管期刊為省級期刊。
2.全國性期刊主管單位:全國性期刊主管單位。
國家期刊的識別方法；
國內期刊分為正式期刊和非正式期刊。正規科技期刊由國家新聞出版署和國家科委在約定的額度內審定，編入國內統壹刊號。辦刊申請比較嚴格。要有壹定的辦刊實力，總編輯和副總編輯必須由高級專業技術人員擔任，對編輯的素質和定員有壹定的要求。正規期刊有獨立辦刊的政策。
非正式期刊是指經行政部門批準領取“內部報批”作為行業內部交流的期刊(壹般限於內部交流，不公開發行)，但也是壹種合法期刊。壹般來說，正式期刊經歷了非正式期刊的過程。
非法期刊是指未經國家新聞出版署和國家科委批準，未登記為內部出版物的非法出版物。他們以盈利為首要目的，收取高額版面費，在技術上和政治上不負責任，不能在中國公開發行或內部發行。他們壹般在國外花300塊買壹個ISSN號來欺騙老師。