唐代,海上絲綢之路建成,石井港是古代泉州港的分支之壹。
南宋紹興十四年(1144),在石井下坊村設立石井巡檢司,管理船只出入大海的事務。
明朝末年,鄭之龍以石井港為據點,編織了壹支多達千艘的船隊,進行海外貿易。
清初,鄭成功在金門、廈駐軍,並組建了東洋艦隊,航行於日本、臺灣省、呂宋等地。石井港也是其貨物集散和船隊停靠的主要港口之壹。鄭誌龍和鄭成功父子先後在南安石井創辦造船廠,建造軍民兩用船,壹年造35艘,修幾十艘。